SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Tek hücreli transkriptomikler, hESC'lerden türetilen insan dopaminerjik progenitörlerinin hücre kader geçişlerini ortaya koymaktadır.

Single-cell transcriptomics reveals the cell fate transitions of human dopaminergic progenitors derived from hESCs.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

Stem Cell Res Ther · 2022-08-13

DOI: 10.1186/s13287-022-03104-7PMID: 35964138

Open accessResearch Support, Non-U.S. Gov't; research-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Arka planOrta beyin dopaminerjik (DA) progenitörleri insan pluripotent kök hücrelerden türetilmiş Parkinson hastalığı (PD) için umut verici bir tedavi olarak kabul edilir. Bununla birlikte, farklılaşma süreci, DA hücrelerinin in vivo değerlendirmesini etkileyen istenmeyen hücre tipleri üretir. Bu makalede, farklılaşma sırasında hücre kaderi seçimini analiz ediyoruz ve hücre hazırlığı hakkında değerli bilgiler veriyoruz.Metodlarİnsan embriyonik kök hücreleri DA progenitörlerine farklılaştırıldı. Farklılaşma hücrelerinin tek hücreli RNA dizilimini (scRNA-seq) farklı zaman noktalarında uyguladık ve gen ekspresyon profillerini araştırdık. DA ve DA olmayan hücreler arasında farklı olarak ifade edilen genlere dayanarak, LGI1 (DA zenginleştirilmiş) aşırı ekspresyonunun DA farklılaşması üzerindeki etkisini ve CD99 (DA zenginleştirilmiş olmayan) sıralamanın zenginleştirici etkisini araştırdık.ResultsTranscriptome analizleri, DA farklılaşma yörüngesinin yanı sıra DA olmayan popülasyonları ve üç anahtar soy dalı noktasını ortaya çıkardı. Genetik kazanç ve işlev kaybı yaklaşımlarını kullanarak, EN1+ erken DA progenitorlerine özgü olan LGI1'in aşırı ekspresyonunun TH+ nöronlarının oluşumunu destekleyebileceğini bulduk. Ayrıca koroid pleksus epitel hücrelerinin ve DA progenitörlerinin son ürünün (25. gün) ana bileşenleri olduğunu ve CD99'un koroid pleksus epitel hücrelerinin spesifik bir yüzey belirteci olduğunu bulduk. CD99- hücrelerinin sıralanması, büyük kirletici hücreleri ortadan kaldırdı ve DA progenitörlerinin saflığını geliştirdi.SonuçlarÇalışmamız, in vitro DA farklılaşmasının tek hücreli transkripsiyonel manzarasını sağlar, bu da DA hazırlamada ve PD hücre tedavisi için kalite kontrolünde gelecekteki iyileştirmelere rehberlik edebilir.

Özgün kaynak özetini okuyun

BackgroundMidbrain dopaminergic (DA) progenitors derived from human pluripotent stem cells are considered to be a promising treatment for Parkinson's disease (PD). However, the differentiation process produces undesired cell types, which influence the in vivo evaluation of DA cells. In this paper, we analyze the cell fate choice during differentiation and provide valuable information on cell preparation.MethodsHuman embryonic stem cells were differentiated into DA progenitors. We applied single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of the differentiation cells at different time points and investigated the gene expression profiles. Based on the differentially expressed genes between DA and non-DA cells, we investigated the impact of LGI1 (DA enriched) overexpression on DA differentiation and the enrichment effect of CD99 (non-DA enriched) sorting.ResultsTranscriptome analyses revealed the DA differentiation trajectory as well as non-DA populations and three key lineage branch points. Using genetic gain- and loss-of-function approaches, we found that overexpression of LGI1, which is specific to EN1+ early DA progenitors, can promote the generation of TH+ neurons. We also found that choroid plexus epithelial cells and DA progenitors are major components of the final product (day 25), and CD99 was a specific surface marker of choroid plexus epithelial cells. Sorting of CD99- cells eliminated major contaminant cells and improved the purity of DA progenitors.ConclusionsOur study provides the single-cell transcriptional landscape of in vitro DA differentiation, which can guide future improvements in DA preparation and quality control for PD cell therapy.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.