SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Asal düzenlemeyi kullanarak yüksek verimli izojenik pluripotent kök hücre modelleri üretimi.

Highly efficient generation of isogenic pluripotent stem cell models using prime editing.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

Elife · 2022-09-07

DOI: 10.7554/elife.79208PMID: 36069759

Open accessResearch Support, Non-U.S. Gov't; research-article; Journal Article; Research Support, N.I.H., ExtramuralKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Asal düzenleme (PE) genom mühendisliği teknolojilerinin son gelişimi, insan pluripotent kök hücre (hPSC) tabanlı hastalık modellerinin oluşumunu önemli ölçüde basitleştirme potansiyeline sahiptir. PE, bir ters transkriptaz (nCas9-RT) ve genişletilmiş bir PE kılavuz RNA (pegRNA) ile kaynaşmış bir Cas9-nickaz kullanan çok bileşenli bir düzenleme sistemidir. Ters transkribe edildikten sonra, pegRNA uzantısı, hedef sitede kesin tasarımcı mutasyonlarını tanıtmak için bir onarım şablonu olarak işlev görür. Burada, PE'nin düzenleme verimliliğini hPSC'lerdeki geleneksel gen düzenleme yöntemleriyle sistematik olarak karşılaştırdık. Bu analiz, PE'nin genel olarak homolojiye özgü nükleaz kaynaklı çift iplikli kırılmaların homoloji yönelimli onarımından daha verimli ve kesin olduğunu ortaya koydu. Spesifik olarak, PE, otozomal dominant hastalıkla ilişkili mutasyonlar oluşturmak için heterozigot düzenleme olayları üretmede daha etkilidir. nCas9-RT'yi hPSC'lere istikrarlı bir şekilde entegre ederek, kanser hücreleri için bildirilenlere eşit düzenleme verimliliği elde ettik, bu da PE bileşenlerinin ifadesinin, hücre-içsel özellikler yerine, hPSC'lerde PE'yi sınırladığını düşündürdü. HPSC'lerde PE'nin verimliliğini artırmak için, PE bileşenleri için teslimat modalitelerini optimize ettik. nCas9-RT'nin mRNA olarak sentetik olarak üretilen, kimyasal olarak modifiye edilmiş pegRNA'lar ve çentik kılavuz RNA'ları ile birleştirilmesi, PE bileşenlerini plazmid veya ribonükleoprotein parçacıkları olarak transfeksiyonla karşılaştırıldığında 13 kata kadar düzenleme verimliliğini geliştirdi. Son olarak, bu mRNA tabanlı teslimat yaklaşımının, %60'ı aşan düzenleme verimliliği sağlamak ve hPSC'lerde Parkinson hastalığına neden olan ailesel mutasyonları düzeltmek veya tanıtmak için tekrar tekrar kullanılabileceğini gösterdik.

Özgün kaynak özetini okuyun

The recent development of prime editing (PE) genome engineering technologies has the potential to significantly simplify the generation of human pluripotent stem cell (hPSC)-based disease models. PE is a multicomponent editing system that uses a Cas9-nickase fused to a reverse transcriptase (nCas9-RT) and an extended PE guide RNA (pegRNA). Once reverse transcribed, the pegRNA extension functions as a repair template to introduce precise designer mutations at the target site. Here, we systematically compared the editing efficiencies of PE to conventional gene editing methods in hPSCs. This analysis revealed that PE is overall more efficient and precise than homology-directed repair of site-specific nuclease-induced double-strand breaks. Specifically, PE is more effective in generating heterozygous editing events to create autosomal dominant disease-associated mutations. By stably integrating the nCas9-RT into hPSCs we achieved editing efficiencies equal to those reported for cancer cells, suggesting that the expression of the PE components, rather than cell-intrinsic features, limit PE in hPSCs. To improve the efficiency of PE in hPSCs, we optimized the delivery modalities for the PE components. Delivery of the nCas9-RT as mRNA combined with synthetically generated, chemically-modified pegRNAs and nicking guide RNAs improved editing efficiencies up to 13-fold compared with transfecting the PE components as plasmids or ribonucleoprotein particles. Finally, we demonstrated that this mRNA-based delivery approach can be used repeatedly to yield editing efficiencies exceeding 60% and to correct or introduce familial mutations causing Parkinson's disease in hPSCs.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.