NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Otomatik analiz araçları hem klinik hem de klinik öncesi uygulamalarda beyin görüntü analizinde popülerdir. Bu bağlamda, yeni bir İstatistiksel Parametrik Haritalama tabanlı şablon ve PET-CT görüntülerinin görüntü kaydı için bir boru hattı içeren fare PET-CT beyin görüntü analizi için yeni bir araç kutusu önerdik. Yeni şablonlar, Allen Referans Atlası'nın (ARA) ortak koordinat çerçevesi (CCFv3) ile uyumluyken, BT tabanlı kayıt adımı fare PET-CT beyin görüntülerinin analizini kolaylaştırmaya olanak tanır. ARA şablonundan, in vivo görüntüleme çalışmaları ile ilgili 27 cilt ilgi alanı belirledik ve bunları tanımlamak için ikili atlas sağladık. [18F]FDG PET-CT ile 20 C57BL/6 fare aldık ve 12 tanesi 3D T2-ağırlıklı yüksek çözünürlüklü MR taramalarına tabi tutuldu. Tüm görüntüler ARA atlas'a elastik olarak kaydedildi ve daha sonra ortalama olarak kaydedildi. Yüksek çözünürlüklü MR görüntüleri, BT tabanlı bir kayıt boru hattını doğrulamak için kullanıldı. Sonuç olarak Parkinson hastalığının bir fare modeline TSPO'ya özgü radyoligand [18F]VC701 ile test-test çalışmasına (n = 6) tabi tutuldu. Mikroglia/makrofaj aktivasyonu bölgelerinin tanımlanması Ma ve Mirrione şablonuna kıyasla gerçekleştirildi. Yeni araç kutusu, Ma ve Mirrione şablonu tarafından tanımlanan 4'e (3'ten sonra) karşı önemli [18F]VC701 alım artışına sahip 11 (6 yanlış keşif oranı ayarından sonra, FDR) beyin alt alanlarını tanımladı. Dahası, bu 11 alan, ARA'nın Fare Bağlama aracını uygulayarak bulunduğu gibi işlevsel olarak bağlanır. Sonuç olarak, MR gerektirmeyen PET-CT görüntüleme analizi için optimize edilmiş bir fare beyni atlası aracı geliştirdik. Bu araç ARA'nın CCFv3'üne uygundur ve fare beyin hastalığı modellerinin analizine uygulanabilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Automatic analysis toolboxes are popular in brain image analysis, both in clinical and in preclinical practices. In this regard, we proposed a new toolbox for mouse PET-CT brain image analysis including a new Statistical Parametric Mapping-based template and a pipeline for image registration of PET-CT images based on CT images. The new templates is compatible with the common coordinate framework (CCFv3) of the Allen Reference Atlas (ARA) while the CT based registration step allows to facilitate the analysis of mouse PET-CT brain images. From the ARA template, we identified 27 volumes of interest that are relevant for in vivo imaging studies and provided binary atlas to describe them. We acquired 20 C57BL/6 mice with [18F]FDG PET-CT, and 12 of them underwent 3D T2-weighted high-resolution MR scans. All images were elastically registered to the ARA atlas and then averaged. High-resolution MR images were used to validate a CT-based registration pipeline. The resulting method was applied to a mouse model of Parkinson's disease subjected to a test-retest study (n = 6) with the TSPO-specific radioligand [18F]VC701. The identification of regions of microglia/macrophage activation was performed in comparison to the Ma and Mirrione template. The new toolbox identified 11 (6 after false discovery rate adjustment, FDR) brain sub-areas of significant [18F]VC701 uptake increase versus the 4 (3 after FDR) macro-regions identified by the Ma and Mirrione template. Moreover, these 11 areas are functionally connected as found by applying the Mouse Connectivity tool of ARA. In conclusion, we developed a mouse brain atlas tool optimized for PET-CT imaging analysis that does not require MR. This tool conforms to the CCFv3 of ARA and could be applied to the analysis of mouse brain disease models.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.