Genetic analysis of dystonia-related genes in Parkinson's disease.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

ObjectiveParkinson hastalığı (PD) ve distoni, klinik fenotipte örtüşen iki yakın ilişkili hareket bozukluğudur. Çeşitli distoni ile ilişkili genlerdeki varyantların PD ile ilişkili olduğu gösterilmiştir; Bununla birlikte, distoni ile ilişkili genlerin PD'ye dahil edilmesi için genetik kanıtlar tam olarak incelenmemiştir. Burada, distoni ile ilgili genlerdeki nadir varyantlar ile büyük bir Çin kohortundaki PD arasındaki ilişkiyi kapsamlı bir şekilde araştırdık. MethodsBiz, 3.959 PD hastasından ve 2.931 sağlıklı kontrolden elde edilen tüm exome dizilimi (WES) ve tüm genom dizilimini (WGS) araştırarak, bilinen 47 distoni ile ilgili genin nadir varyantlarını kapsamlı bir şekilde analiz ettik. Başlangıçta farklı kalıtım modellerine dayanan PD'li hastalarda distoni ile ilişkili genlerin potansiyel patojenik varyantlarını belirledik. Sıralı kernel ilişkilendirme testleri, nadir varyantların yükü ile PD riski arasındaki ilişkiyi tespit etmek için bir sonraki adımda gerçekleştirildi.SonuçlarPD'li beş hastanın, COL6A3 ve TH dahil olmak üzere resesif distoni ile ilişkili genlerde potansiyel patojenik biallelik varyantlar taşıdığını tespit ettik. Ek olarak, dominant distoni ile ilgili genlerde hesaplamalı patojenlik tahminlerine dayanan 180 zararlı varyant tespit ettik ve bunlardan dördü potansiyel patojenik varyantlar olarak kabul edildi (p.W591X ve p.G820S ANO3, ADCY5'te p.R678H ve SLC2A1'de p.R458Q). Gen tabanlı bir yük analizi, sporadik erken başlangıçlı PD'de TH, SQSTM1, THAP1 ve ADCY5'in varyant alt gruplarının artan yükünü ortaya çıkarırken, COL6A3 sporadik geç başlangıçlı PD ile ilişkilendirildi. Bununla birlikte, hiçbiri Bonferroni düzeltmesinden sonra istatistiksel öneme ulaşamadı.Sonuç Bulgularımız, birkaç distoni ile ilişkili gendeki nadir varyantların PD ile düşündürücü bir şekilde ilişkili olduğunu ve birlikte alındığında, COL6A3 ve TH genlerinin PD'deki rolünün vurgulandığını göstermiştir.

Özgün kaynak özetini okuyun

ObjectiveParkinson's disease (PD) and dystonia are two closely related movement disorders with overlaps in clinical phenotype. Variants in several dystonia-related genes were demonstrated to be associated with PD; however, genetic evidence for the involvement of dystonia-related genes in PD has not been fully studied. Here, we comprehensively investigated the association between rare variants in dystonia-related genes and PD in a large Chinese cohort.MethodsWe comprehensively analyzed the rare variants of 47 known dystonia-related genes by mining the whole-exome sequencing (WES) and whole-genome sequencing (WGS) data from 3,959 PD patients and 2,931 healthy controls. We initially identified potentially pathogenic variants of dystonia-related genes in patients with PD based on different inheritance models. Sequence kernel association tests were conducted in the next step to detect the association between the burden of rare variants and the risk for PD.ResultsWe found that five patients with PD carried potentially pathogenic biallelic variants in recessive dystonia-related genes including COL6A3 and TH. Additionally, we identified 180 deleterious variants in dominant dystonia-related genes based on computational pathogenicity predictions and four of which were considered as potentially pathogenic variants (p.W591X and p.G820S in ANO3, p.R678H in ADCY5, and p.R458Q in SLC2A1). A gene-based burden analysis revealed the increased burden of variant subgroups of TH, SQSTM1, THAP1, and ADCY5 in sporadic early-onset PD, whereas COL6A3 was associated with sporadic late-onset PD. However, none of them reached statistical significance after the Bonferroni correction.ConclusionOur findings indicated that rare variants in several dystonia-related genes are suggestively associated with PD, and taken together, the role of COL6A3 and TH genes in PD is highlighted.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.