EEF1A1 is Involved the Regulating Neuroinflammatory Processes in Parkinson's Disease.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

BackgroundStudies, RNA bağlayıcı protein Ökaryotik Uzama Faktörü 1A1 (EEF1A1)'in Alzheimer hastalığının (AD) hipokampal bölgesinde düşük eksprese edildiğini bildirmiştir. Ek olarak, hücrelerdeki PARK2 aktivitesi ile ilgilidir ve nörodejeneratif hastalıklardaki önemini tahmin eder. Bununla birlikte, Parkinson hastalığında (PD) EEF1A1'in işlevi belirsizdir. Çalışmamızın birincil amacı, U251 hücrelerinde EEF1A1'i yıkmak ve PD nöroinflamasyonunda EEF1A1'in rolünü öncelikli olarak araştırmaktı.MetodlarEEF1A1'in U251 hücrelerinde ifade edilmesini engellemek için, siRNA bu hücrelere aktarıldı. Daha sonra, RNA-seq dizilimi, EEF1A1 knockdown'dan kaynaklanan Diferansiyel İfadeli Genleri (DEG'ler) belirlemek için kullanıldı. Buna ek olarak, gen ve genomların gen ontolojisi (GO) ve kyoto ansiklopedisi (KEGG) zenginleştirme analizleri, DEG'lerle uğraşan biyolojik süreçleri ve sinyal yollarını bulmak ve PD'nin gelişimini etkileyen nöroenflamatuar süreçlerle ilişkili genleri taramak için gerçekleştirildi. Daha fazla Gerçek Zamanlı - nicel Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-qPCR) doğrulama deneyleri, sıralama sonuçlarının güvenilirliğini doğrulamak için gerçekleştirildi. Son olarak, ilgili literatürün desteğiyle birlikte, PD'nin nöroenflamatuar sürecini düzenlemede EEF1A1'in moleküler mekanizması başlangıçta araştırıldı. RNA-seq tekniğini kullanan Sonuçlar Analiz, EEF1A1'in IL-6, GDF15, STC1, MT1E, GPNMB, CCL5, MT1X, A2M ve VIP genlerinin transkripsiyon düzeyinde ekspresyonunu önemli ölçüde artırabileceğini gösterdi. Bu dokuz yüksek seviyeli gen, enflamatuar süreçlere bağlı sinyal yolları ile zenginleştirildi, GO ve KEGG zenginleştirmesinin bir analizine göre.ConclusionsEEF1A1, PD'nin nöroinflamatuar süreci ile ilişkili IL-6, GDF15, STC1, MT1E, GPNMB, CCL5, MT1X, A2M ve VIP genlerinin düzenlenmesinde yer almaktadır. Bunlar arasında, GDF15, STC1, MT1E, MT1X, GPNMB, VIP ve A2M genlerinin PD'nin nöroinflamatuar sürecini geciktirmede yer aldığını, IL-6 ve CCL5'in nöroinflamatuar süreci şiddetlendirmede yer aldığını ve EEF1A1'in PD nöroinflamasyonunun düzenlenmesine katılabileceğini belirttik.

Özgün kaynak özetini okuyun

BackgroundStudies have reported that the RNA-binding protein Eukaryotic Elongation Factor 1A1 (EEF1A1) is low expressed in the hippocampal region of Alzheimer's disease (AD). In addition, it is related to PARK2 activity in cells, predicting its importance in neurodegenerative diseases. However, the function of EEF1A1 in Parkinson's disease (PD) is unclear. Our study's primary objective was to knock down EEF1A1 in U251 cells and preliminarily explore the role of EEF1A1 in PD neuroinflammation.MethodsTo inhibit EEF1A1 from being expressed in U251 cells, siRNA was transfected into those cells. Then, RNA-seq sequencing was used to determine the Differentially Expressed Genes (DEGs) resulting from the EEF1A1 knockdown. Additionally, gene ontology (GO) and kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) enrichment analyses were performed to find the biological processes and signaling pathways engaged in the DEGs, as well as to screen for genes associated with neuroinflammatory processes that influence the development of PD. Further Real Time - quantitative Polymerase Chain Reaction (RT-qPCR) validation experiments were performed to confirm the reliability of the sequencing results. Finally, combined with the support of related literature, the molecular mechanism of EEF1A1 in regulating the neuroinflammatory process of PD was initially explored.ResultsAnalysis using the RNA-seq technique showed that EEF1A1 knockdown could significantly upregulate the expression of IL-6, GDF15, STC1, MT1E, GPNMB, CCL5, MT1X, A2M, and VIP genes at the transcriptional level. These nine highly elevated genes were enriched to signaling pathways linked to inflammatory processes, according to an analysis of GO and KEGG enrichment.ConclusionsEEF1A1 is involved in the regulating of IL-6, GDF15, STC1, MT1E, GPNMB, CCL5, MT1X, A2M, and VIP genes associated with the neuroinflammatory process of PD. Among them, we found that GDF15, STC1, MT1E, MT1X, GPNMB, VIP, and A2M genes were involved in delaying the neuroinflammatory process of PD, while IL-6 and CCL5 were involved in exacerbating the neuroinflammatory process, implicating that EEF1A1 may participate in the regulation of the PD neuroinflammation.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.