Overlap in synaptic neurological condition susceptibility pathways and the neural pannexin 1 interactome revealed by bioinformatics analyses

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Birçok nörolojik durum sinaptik bozukluklar gösterir, bu da mekanistik yakınsamayı düşündürür. Ek olarak, pannexin 1 (PANX1) kanalı ve sinyal iskelesi bu nörolojik koşulların birkaçıyla bağlantılıdır ve sinaptik gelişme ve plastisitenin ortaya çıkan bir düzenleyicisidir; Bununla birlikte, sinaptik patojenik katkıları nispeten keşfedilmemiştir. Bu amaçla, genom çapında dernek çalışmaları (GWASs) tarafından keşfedilen sinaptik nörogelişimsel bozukluk ve nörodejeneratif hastalık duyarlılık genleri ile fare Neuro2a (N2a) hücrelerinden tanımlanan nöral PANX1 interaktom (483 protein) arasındaki bağlantıları araştırdık. Paylaşılan duyarlılık genlerini tanımlamak için, otizm spektrum bozuklukları, şizofreni, Parkinson hastalığı ve Alzheimer hastalığı arasında sinaptik düşündürücü GWAS aday genlerini karşılaştırdık. PANX1 sinyal yollarını sinapsta daha fazla araştırmak için, PANX1 etkileşim sinyal yollarını ve protein-protein etkileşim kümelerini tanımlamak için biyoinformatik araçlarını kullandık. PANX1 ve bu dört nörolojik durumu potansiyel olarak bağlayan sinaptik hastalık mekanizmalarına ışık tutmak için, PANX1 sinaptik ve hastalık-şüpheli gen setleri için zenginleştirilmiş gen ontolojileri arasında ek çapraz analizler gerçekleştirdik. Son olarak, sinaptik PANX1-nörolojik durum bağlantılarının bölgesel özgüllüğünü araştırmak için, sinaptik PANX1 interaktomunun ve GWAS aday gen seti transkriptlerinin beyin bölgesine özgü yükseltilerini belirledik. Sonuçlarımız, otizm spektrum bozuklukları ve şizofreni için risk genlerinde önemli ölçüde örtüşme olduğunu doğrular ve nörogelişimsel bozukluklar ve nörodejeneratif hastalıklar için genetik duyarlılıkta potansiyel ortak noktaları tanımlar. Bulgularımız ayrıca, veziküler kaçakçılık ve proteostazın düzenlenmesi gibi sinaptik hastalıkla ilişkili yollara yeni putatif PANX1 bağlantılarının tespit edildiğini ve daha fazla doğrulamayı garanti ettiğini ortaya koydu.

Özgün kaynak özetini okuyun

Many neurological conditions exhibit synaptic impairments, suggesting mechanistic convergence. Additionally, the pannexin 1 (PANX1) channel and signaling scaffold is linked to several of these neurological conditions and is an emerging regulator of synaptic development and plasticity; however, its synaptic pathogenic contributions are relatively unexplored. To this end, we explored connections between synaptic neurodevelopmental disorder and neurodegenerative disease susceptibility genes discovered by genome-wide association studies (GWASs), and the neural PANX1 interactome (483 proteins) identified from mouse Neuro2a (N2a) cells. To identify shared susceptibility genes, we compared synaptic suggestive GWAS candidate genes amongst autism spectrum disorders, schizophrenia, Parkinson's disease, and Alzheimer's disease. To further probe PANX1 signaling pathways at the synapse, we used bioinformatics tools to identify PANX1 interactome signaling pathways and protein-protein interaction clusters. To shed light on synaptic disease mechanisms potentially linking PANX1 and these four neurological conditions, we performed additional cross-analyses between gene ontologies enriched for the PANX1 synaptic and disease-susceptibility gene sets. Finally, to explore the regional specificity of synaptic PANX1-neurological condition connections, we identified brain region-specific elevations of synaptic PANX1 interactome and GWAS candidate gene set transcripts. Our results confirm considerable overlap in risk genes for autism spectrum disorders and schizophrenia and identify potential commonalities in genetic susceptibility for neurodevelopmental disorders and neurodegenerative diseases. Our findings also pinpointed novel putative PANX1 links to synaptic disease-associated pathways, such as regulation of vesicular trafficking and proteostasis, warranting further validation.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.