NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Mitokondriyal disfonksiyon Parkinson hastalığında (PD) iyi yerleşmiştir; Bununla birlikte, hücre organel bağlantısı ile ilişkili işlev bozuklukları bilinmemektedir. Mitokondri ile endopalmik retikulum (ER) arasındaki organel bağlantısında yer alan önemli sitosolik proteini, önemli PD proteinini bağlayan organelleri sunan fonksiyonel kümeleri çıkarmak için bir organel protein ağı oluşturarak hesaplamalı bir yaklaşımla kurmayı amaçladık. Daha sonra, anti-parkinsonizm ilaçlarının (n = 35) moleküler kenetlenme ve moleküler dinamik simülasyon yoluyla çok önemli protein üzerindeki etkisini değerlendirdik ve PD katılımcılarında gen ifadesini daha da doğruladık, istradefyllin (n = 25) ve amantadin (n = 25) tedavisi. Araştırmamıza dayanarak, D-aspartat oksidaz (DDO) proteininin hem mitokondriyi hem de ER'yi bağlayan kritik olduğu bulundu. Ayrıca, moleküler kenetlenme, istradefyllin'in DDO proteinine karşı yüksek afiniteye (-9.073 kcal / mol) sahip olduğunu ve bu da mitokondriyal-ER bağlantısını bozabileceğini gösterdi. Amantadine (-4.53 kcal/mol) DDO'ya karşı ilaç bağlanmasında konformasyonel değişikliklere katkıda bulunan ihmal edilebilir etkiler gösterirken, başarılı bir şekilde, DDO gen ekspresyonu iztrafilin ile tedavi edilen PD katılımcılarında azalmıştır ve bu da iztrafilinin hedef dışı mekanizma olasılığını aydınlatmıştır. Genel olarak, bulgularımız anti-parkinsonizm ilaçlarının DDO proteini üzerindeki hedef dışı etkilerini aydınlatarak hedef dışı PD tedavilerinin tavsiyesini mümkün kılmaktadır.
Özgün kaynak özetini okuyun
Mitochondrial dysfunction is well-established in Parkinson's disease (PD); however, its dysfunctions associating with cell organelle connectivity remain unknown. We aimed to establish the crucial cytosolic protein involved in organelle connectivity between mitochondria and the endopalmic reticulum (ER) through a computational approach by constructing an organelle protein network to extract functional clusters presenting the crucial PD protein connecting organelles. Then, we assessed the influence of anti-parkinsonism drugs (n = 35) on the crucial protein through molecular docking and molecular dynamic simulation and further validated its gene expression in PD participants under, istradefylline (n = 25) and amantadine (n = 25) treatment. Based on our investigation, D-aspartate oxidase (DDO )protein was found to be the critical that connects both mitochondria and the ER. Further, molecular docking showed that istradefylline has a high affinity (-9.073 kcal/mol) against DDO protein, which may disrupt mitochondrial-ER connectivity. While amantadine (-4.53 kcal/mol) shows negligible effects against DDO that contribute to conformational changes in drug binding, Successively, DDO gene expression was downregulated in istradefylline-treated PD participants, which elucidated the likelihood of an istradefylline off-target mechanism. Overall, our findings illuminate the off-target effects of anti-parkinsonism medications on DDO protein, enabling the recommendation of off-target-free PD treatments.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.