NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Arka planAlzheimer hastalığı (AD) ve Parkinson hastalığı (PD), iki yaygın geri dönüşümsüz nörodejeneratif hastalık, olfaksiyon disfonksiyonu gibi benzer erken evre sendromlarını paylaşır. Yine de, AD ve PD'nin potansiyel komorbidite mekanizması tam olarak aydınlatılmamıştır.MetodlarGSE5281 ve GSE8397'nin gen ekspresyon profilleri Gene Expression Omnibus (GEO) veritabanından indirildi. Üst üste binen diferansiyel ifade edilmiş genleri (DEG'ler) görüntülemek için bir dizi biyoinformatik analiz kullandık. Hub genleri, Cytoscape'in CytoHubba eklentisi tarafından daha da tanımlandı ve APP / PS-1 transgenik farelerin hipokampus (HIP) örneklerinde ve A53T transgenik farelerin önemli nigra (SN) örneklerinde gerçek zamanlı niceliksel polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) ile doğrulandı. Bu arada, olfaktör epitel/bulbdaki hedef genlerin ekspresyonu RT-qPCR tarafından tespit edildi. Son olarak, hedef gen için potansiyel bileşikleri görüntülemek için moleküler kenetlenme kullanıldı.Sonuçlar AD ve PD'de yüz yetmiş dört üst üste binen DEG tespit edildi. İlk on zenginleştirme yolunun beşi esas olarak sinaps üzerine odaklanmıştır. Beş hub geni tanımlandı ve daha da doğrulandı. AD ve PD'de yaygın bir faktör olarak, koku epitelyum / bulb'daki sinaptozomal ilişkili protein 25 (SNAP25) mRNA'nın değişiklikleri önemli ölçüde azalmış ve HIP ve SN örneklerindekilerle güçlü bir ilişki yaşamıştır. Pazopanib, SNAP25'i hedefleyen en uygun bileşikti, -9.2 kcal / mol'luk bir bağlanma enerjisi ile.Sonuçlarımız AD ve PD'nin komorbidite mekanizmasını anlamak için teorik bir temel sağladı ve koku epitelindeki SNAP25'in hem AD hem de PD'de erken tespit ve müdahale için potansiyel bir hedef olabileceğini vurguladı.
Özgün kaynak özetini okuyun
BackgroundAlzheimer's disease (AD) and Parkinson's disease (PD), two common irreversible neurodegenerative diseases, share similar early stage syndromes, such as olfaction dysfunction. Yet, the potential comorbidity mechanism of AD and PD was not fully elucidated.MethodsThe gene expression profiles of GSE5281 and GSE8397 were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. We utilized a series of bioinformatics analyses to screen the overlapped differentially expressed genes (DEGs). The hub genes were further identified by the plugin CytoHubba of Cytoscape and validated in the hippocampus (HIP) samples of APP/PS-1 transgenic mice and the substantial nigra (SN) samples of A53T transgenic mice by real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Meanwhile, the expression of the target genes in the olfactory epithelium/bulb was detected by RT-qPCR. Finally, molecular docking was used to screen potential compounds for the target gene.ResultsOne hundred seventy-four overlapped DEGs were identified in AD and PD. Five of the top ten enrichment pathways mainly focused on the synapse. Five hub genes were identified and further validated. As a common factor in AD and PD, the changes of synaptosomal-associated protein 25 (SNAP25) mRNA in olfactory epithelium/bulb were significantly decreased and had a strong association with those in the HIP and SN samples. Pazopanib was the optimal compound targeting SNAP25, with a binding energy of - 9.2 kcal/mol.ConclusionsOur results provided a theoretical basis for understanding the comorbidity mechanism of AD and PD and highlighted that SNAP25 in the olfactory epithelium may serve as a potential target for early detection and intervention in both AD and PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.