Genetic markers associated with ferroptosis in Alzheimer's disease.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

ObjectiveFerroptoz, Alzheimer hastalığı, Parkinson hastalığı ve vasküler demans gibi nörodejeneratif bozuklukların patogenezine dahil edilir ve bu hastalıkların ilerlemesi üzerinde düzenleyici bir etkiye sahip olabileceğini ima eder. Bununla birlikte, ferroptozla ilişkili genlerin (FRG'ler) Alzheimer hastalığındaki (AD) spesifik rolü henüz tam olarak anlaşılamamıştır. Çalışmanın amacı, ferroptoz ile ilişkili genleri hastalıkta düzenleyici fonksiyonlarla tespit etmek ve AD.MethodsHub FRG'lerde potansiyel mekanizmaları araştırmaktı. GSE5281 veri kümesine dayalı çoklu algoritmalar yoluyla elde edildi. Tarama süreci limma, WGCNA, glom ve SVM-RFE dahil olmak üzere R paketleri tarafından uygulandı. Gen Ontoloji sınıflandırması ve yol zenginleştirme analizi FRG'lere göre yapılmıştır. Hub FRG'lerle ilgili biyolojik süreçler GSVA ve GSEA yöntemleri ile araştırılmıştır. Bağışıklık infiltrasyon analizi R paketi CIBERSORT tarafından gerçekleştirildi. Alıcı işletim karakteristik eğrisi (ROC), hub FRG'lerin doğruluğunu doğrulamak için kullanıldı. CeRNA ağı, hastalık ilerlemesinde rol oynayabilecek kodlamayan RNA transkriptlerini bulmaya çalıştı.ResultsDDDIT4, MUC1, KLHL24, CD44 ve RB1, hub FRG'ler olarak tanımlandı. Daha sonra zenginleştirme analizi ile ortaya çıktığı gibi, hub FRG'lerin otofaji ve glutatyon metabolizması gibi çeşitli AD patogenezine bağlı yollara dahil olması yoluyla AD üzerinde önemli etkileri vardı. AD'deki bağışıklık mikro ortamı, sağlıklı örneklerle karşılaştırıldığında CD8 T hücrelerinin azalmış seviyeleri ile artan sayıda dinlenme NK hücresi, makrofajlar ve mast hücreleri göstermektedir. Düzenleyici T hücreleri MUC1, KLHL24 ve DDIT4 ekspresyonu ile pozitif korelasyon gösterirken, RB1 eozinofiller ve CD8 T hücreleri ile negatif korelasyonlar gösterdi ve AD'de bağışıklık ortamının modüle edilmesinde potansiyel roller önerdi. Ferroptozun hastalığa dahil olabileceği sonucuna vardık.

Özgün kaynak özetini okuyun

ObjectiveFerroptosis is implicated in the pathogenesis of neurodegenerative disorders such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease, and vascular dementia, implying that it may have a regulatory effect on the progression of these diseases. However, the specific role of ferroptosis-related genes (FRGs) in Alzheimer's disease (AD) is not yet fully understood. The aim of the study was to detect ferroptosis related genes with regulatory functions in the disease and explore potential mechanisms in AD.MethodsHub FRGs were obtained through multiple algorithms based on the GSE5281 dataset. The screening process was implemented by R packages including limma, WGCNA, glm and SVM-RFE. Gene Ontology classification and pathway enrichment analysis were performed based on FRGs. Biological processes involved with hub FRGs were investigated through GSVA and GSEA methods. Immune infiltration analysis was performed by the R package CIBERSORT. Receiver operating characteristic curve (ROC) was utilized to validate the accuracy of hub FRGs. The CeRNA network attempted to find non-coding RNA transcripts which may play a role in disease progression.ResultsDDIT4, MUC1, KLHL24, CD44, and RB1 were identified as hub FRGs. As later revealed by enrichment analysis, the hub FRGs had important effects on AD through involvement in diverse AD pathogenesis-related pathways such as autophagy and glutathione metabolism. The immune microenvironment in AD shows increased numbers of resting NK cells, macrophages, and mast cells, with decreased levels of CD8 T cells when compared to healthy samples. Regulatory T cells were positively correlated with MUC1, KLHL24, and DDIT4 expression, while RB1 showed negative correlations with eosinophils and CD8 T cells, suggesting potential roles in modulating the immune environment in AD.ConclusionOur research has identified five hub FRGs in AD. We concluded that ferroptosis may be involved in the disease.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.