Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Son zamanlarda yapılan çalışmalar, Parkinson hastalığı (PD) ve kanser, görünüşte farklı iki hastalık kategorisi arasındaki ilgi çekici bağlantıları ortaya çıkarmıştır. Disülfidptoz, nörodejeneratif bozukluklar ve kanser de dahil olmak üzere çeşitli patolojik koşullarda yer alan yeni bir düzenlenmiş hücre ölümü biçimi olarak dikkat çekmiştir. Disülfidptoz, hücre içi redoks homeostazın disregülasyonunu içerir, bu da disülfid bağlarının birikmesine ve ardından hücre ölümünün artmasına yol açar. Bu, nörodejeneratif hastalıklar ve tümörigenezi arasındaki ilişkide yer alabilecek ortak moleküler mekanizmaları ve genetik faktörleri keşfetmeye olan ilgimizi tetiklemiştir. Gene4PD veri tabanı PD diferansiyel olarak ifade edilen genleri (DEG'ler), diferansiyel ifade disülfidptozla ilişkili genlerin (DEDRG'ler) biyolojik işlevleri analiz edildi, DEDRG'lerin ROC'ları GEO veri tabanı kullanılarak analiz edildi ve DEDRG'lerin ifadesi in vivo'da MPTP kaynaklı PD fare modeli tarafından doğrulandı. Daha sonra, 30'dan fazla kanserden 9000'den fazla örnekteki DEDRG'ler, multi-omik analiz verileri kullanılarak kapsamlı ve sistematik olarak karakterize edildi. PD'de, ACTB, ACTN4, INF2 ve MYL6 dahil olmak üzere toplam dört DEDRG elde ettik. Zenginleştirilmiş biyolojik fonksiyonlar NF-kappaB sinyal yolu, mitokondriyal fonksiyon, apoptoz ve tümör nekroz faktörünün düzenlenmesini içerir ve bu genler farklı beyin bölgelerinde zengindir. MPTP kaynaklı PD fare modelinde ACTB'nin ekspresyonu azalırken, ACTN4, INF2 ve MYL6'nın ekspresyonu artırıldı. Pan-kanserde, GBMLGG, LGG, MESO ve LAML'deki ACTB, ACTN4 ve MYL6'nın yüksek ekspresyonunun kötü bir prognozu vardı ve LIHC, LUAD, UVM, HNSC, GBM, LAML ve KIPAN'daki INF2'nin yüksek ekspresyonunun kötü bir prognozu vardı. Çalışmamız, bu genlerin pan-kanser hastalarında Makrofajlar, NK hücreleri, Nötrofiller, Eozinofiller, CD8 T hücreleri, T hücreleri, T yardımcı hücreleri, B hücreleri, dendritik hücreler ve mast hücrelerinde daha fazla sızdığını göstermiştir. Çoğu ikame mutasyonu G-A geçişleri ve C-T geçişleri idi. Ayrıca miR-4298, miR-296-3p, miR-150-3p, miR-493-5p ve miR-6742-5p'nin kanser ve PD'de önemli roller oynadığını bulduk. Cycloposphamide ve etinil estradiol, gelecekteki araştırmalar için DEDRG'lerden etkilenen potansiyel ilaçlar olabilir. Bu çalışma, ACTB, ACTN4, INF2 ve MYL6'nın PD ve pan-kanser ile yakından ilişkili olduğunu ve nörodejeneratif hastalıkların ve kanserlerin tanı, prognoz ve terapötik biyobelirteçleri için aday genler olarak kullanılabileceğini bulmuştur.
Özgün kaynak özetini okuyun
Recent studies have uncovered intriguing connections between Parkinson's disease (PD) and cancer, two seemingly distinct disease categories. Disulfidptosis has garnered attention as a novel form of regulated cell death that is implicated in various pathological conditions, including neurodegenerative disorders and cancer. Disulfidptosis involves the dysregulation of intracellular redox homeostasis, leading to the accumulation of disulfide bonds and subsequent cell demise. This has sparked our interest in exploring common molecular mechanisms and genetic factors that may be involved in the relationship between neurodegenerative diseases and tumorigenesis. The Gene4PD database was used to retrieve PD differentially expressed genes (DEGs), the biological functions of differential expression disulfidptosis-related genes (DEDRGs) were analyzed, the ROCs of DEDRGs were analyzed using the GEO database, and the expression of DEDRGs was verified by an MPTP-induced PD mouse model in vivo. Then, the DEDRGs in more than 9000 samples of more than 30 cancers were comprehensively and systematically characterized by using multi-omics analysis data. In PD, we obtained a total of four DEDRGs, including ACTB, ACTN4, INF2, and MYL6. The enriched biological functions include the regulation of the NF-κB signaling pathway, mitochondrial function, apoptosis, and tumor necrosis factor, and these genes are rich in different brain regions. In the MPTP-induced PD mouse model, the expression of ACTB was decreased, while the expression of ACTN4, INF2, and MYL6 was increased. In pan-cancer, the high expression of ACTB, ACTN4, and MYL6 in GBMLGG, LGG, MESO, and LAML had a poor prognosis, and the high expression of INF2 in LIHC, LUAD, UVM, HNSC, GBM, LAML, and KIPAN had a poor prognosis. Our study showed that these genes were more highly infiltrated in Macrophages, NK cells, Neutrophils, Eosinophils, CD8 T cells, T cells, T helper cells, B cells, dendritic cells, and mast cells in pan-cancer patients. Most substitution mutations were G-to-A transitions and C-to-T transitions. We also found that miR-4298, miR-296-3p, miR-150-3p, miR-493-5p, and miR-6742-5p play important roles in cancer and PD. Cyclophosphamide and ethinyl estradiol may be potential drugs affected by DEDRGs for future research. This study found that ACTB, ACTN4, INF2, and MYL6 are closely related to PD and pan-cancer and can be used as candidate genes for the diagnosis, prognosis, and therapeutic biomarkers of neurodegenerative diseases and cancers.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.