Ancient viral DNA in the human genome linked to neurodegenerative diseases.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Arka planİnsan endojen retrovirüsler (HERV'ler), evrimimiz sırasında eski retrovirüslerle enfeksiyonlardan kaynaklanan insan genomundaki dizilerdir. Önceki çalışmalar HERV'leri nörodejeneratif hastalıklarla ilişkilendirmiştir, ancak etiyolojideki rollerini tanımlamak zor olmuştur. Burada, nörodejeneratif hastalıklar için genetik risk ile beyindeki HERV ekspresyonu arasındaki ilişkileri değerlendirmek için retrotranscriptome çapında bir ilişki çalışması (rTWAS) yaklaşımı kullandık, genomik hassasiyetle hesaplandı.MetodlarAlzheimer hastalığı, amyotrofik lateral skleroz, multipl skleroz ve Parkinson hastalığı ile ilgili genetik ilişki istatistiklerini analiz ettik, 792 kortikal örnekten hesaplanan HERV ekspresyon modellerini kullandık. Sağlam risk faktörleri, şartlı ve ortak analizlerde de önemli olan ve ince haritalama analizlerinde 0.5'in üzerinde bir posterior dahil olma olasılığı olan birincil analizde çoklu test düzeltmesinden kurtulanlar olarak kabul edildi.Sonuçlar Birincil analiz, nörodejeneratif hastalık duyarlılığı ile ilişkili 12 HERV ekspresyon imzasını tanımladı. Kromozom 12q14 (MER61_12q14.2) üzerinde amyotrofik lateral skleroz ile sağlam bir şekilde ilişkili bir HERV ifade imzası ve kromozom 1p36 (ERVLE_1p36.32a) üzerinde multipl skleroz ile sağlam bir şekilde ilişkili bir tane bulduk. Bir ortak ifade analizi, bu HERV'lerin plazma zarı yapışma molekülleri yoluyla homofilik hücre yapışmasında yer aldığını öne sürdü.SonuçlarAmiyotrofik lateral skleroz ve multipl skleroz skleroz sklerozu ile güçlü bir şekilde ilişkili HERV ekspresyon profillerini bulduk, nörodejeneratif hastalığın altında yatan yeni risk mekanizmalarını vurguladık ve terapötik müdahale için potansiyel yeni hedefler sunduk.

Özgün kaynak özetini okuyun

BackgroundHuman endogenous retroviruses (HERVs) are sequences in the human genome that originated from infections with ancient retroviruses during our evolution. Previous studies have linked HERVs to neurodegenerative diseases, but defining their role in aetiology has been challenging. Here, we used a retrotranscriptome-wide association study (rTWAS) approach to assess the relationships between genetic risk for neurodegenerative diseases and HERV expression in the brain, calculated with genomic precision.MethodsWe analysed genetic association statistics pertaining to Alzheimer's disease, amyotrophic lateral sclerosis, multiple sclerosis, and Parkinson's disease, using HERV expression models calculated from 792 cortical samples. Robust risk factors were considered those that survived multiple testing correction in the primary analysis, which were also significant in conditional and joint analyses, and that had a posterior inclusion probability above 0.5 in fine-mapping analyses.ResultsThe primary analysis identified 12 HERV expression signatures associated with neurodegenerative disease susceptibility. We found one HERV expression signature robustly associated with amyotrophic lateral sclerosis on chromosome 12q14 (MER61_12q14.2) and one robustly associated with multiple sclerosis on chromosome 1p36 (ERVLE_1p36.32a). A co-expression analysis suggested that these HERVs are involved in homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules.ConclusionsWe found HERV expression profiles robustly associated with amyotrophic lateral sclerosis and multiple sclerosis susceptibility, highlighting novel risk mechanisms underlying neurodegenerative disease, and offering potential new targets for therapeutic intervention.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.