Distinct fingerprints of tRNA-derived small non-coding RNA in animal models of neurodegeneration.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Transfer RNA türevli küçük RNA'lar (tsRNA'lar) - tRNA türevli parçalar (TRF'ler), tRNA türevli stres kaynaklı RNA'lar (tiRNA'lar) ve dahili TRF (iRF) olarak kategorize edilir - çeviri inhibisyonu ve hücresel strese yanıtlar gibi çeşitli hücresel süreçlere katılan küçük kodlamayan RNA'lardır. Burada, hastalığa özgü tsRNA'ları ve nörodejeneratif hastalıklar arasında paylaşılanları belirlemek için amyotrofik lateral skleroz (ALS), frontotemporal demans (FTD) ve Parkinson hastalığının (PD) hayvan modellerindeki duyarlı dokulardaki tsRNA profillerini belirledik. SOD1G93A ve TDP43A315T fare modellerinde ALS (spinal kord), FTD (hippocampus) TauP301S modelinde ve PD (substantia nigra) parkin/POLG modelinde küçük RNA dizilemesi yaptık. Biyoinformatik analiz, iki ALS modelinde seçici olarak 5' tiRNA'nın daha yüksek ekspresyonunu, hem ALS hem de FTD fare modellerinde 3' tRF'nin düşük ekspresyonunu ve PD modelinde itRF Arg'ın daha düşük ekspresyonunu gösterdi. Deneysel doğrulama, tsRNA'ların ifadesini doğruladı. Doğrulanmış 3' tRF'lerle ilişkili hedeflerin gen ontoloji analizi, sinaptik ve nöronal yolların düzenlenmesinde işlevleri göstermiştir. tsRNA'ların profillemesi, insan hastalığında doğrulama gerektiren nörodejenerasyonun hayvan modellerinde hastalığa özgü parmak izlerini gösterir.

Özgün kaynak özetini okuyun

Transfer RNA-derived small RNAs (tsRNAs) - categorized as tRNA-derived fragments (tRFs), tRNA-derived stress-induced RNAs (tiRNAs) and internal tRF (itRF) - are small non-coding RNAs that participate in various cellular processes such as translation inhibition and responses to cellular stress. We here identified tsRNA profiles within susceptible tissues in animal models of amyotrophic lateral sclerosis (ALS), frontotemporal dementia (FTD) and Parkinson's disease (PD) to pinpoint disease-specific tsRNAs and those shared across neurodegenerative diseases. We performed small RNA sequencing in the SOD1G93A and TDP43A315T mouse models of ALS (spinal cord), the TauP301S model of FTD (hippocampus), and the parkin/POLG model of PD (substantia nigra). Bioinformatic analysis showed higher expression of 5' tiRNAs selectively in the two ALS models, lower expression of 3' tRFs in both the ALS and FTD mouse models, and lower expression of itRF Arg in the PD model. Experimental validation confirmed the expression of tsRNAs. Gene Ontology analysis of targets associated with validated 3' tRFs indicated functions in the regulation of synaptic and neuronal pathways. Our profiling of tsRNAs indicates disease-specific fingerprints in animal models of neurodegeneration, which require validation in human disease.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.