SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · MED

Lipidlerin Sıralı MALDI-MSI Analizi için Kapsamlı Yaklaşım, <i>N</i>-Glikanlar ve Taze Donmuş Kemirgen Beyin Dokularında Peptitler.

Comprehensive Approach for Sequential MALDI-MSI Analysis of Lipids, <i>N</i>-Glycans, and Peptides in Fresh-Frozen Rodent Brain Tissues.

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

Anal Chem · 2025-01-09

DOI: 10.1021/acs.analchem.4c05665PMID: 39781894

Open accessResearch Support, Non-U.S. Gov't; research-article; Journal ArticleKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Matris destekli lazer desorpsiyonu/iyonizasyon kütle spektrometrisi görüntülemesi (MALDI-MSI) kullanılarak tek doku bölümlerinin multiomik analizi kapsamlı moleküler anlayışlar sağlar. Bununla birlikte, MALDI-MSI için doku örnekleme hazırlığının optimize edilmesi, lipidler, N-glikanlar ve triptik peptidler gibi çeşitli biyomoleküller için yüksek hassasiyet ve tekrarlanabilirlik elde etmek için önemli bir zorluk sunar. Bu çalışma, taze dondurulmuş kemirgen beyin dokusu örneklerinde MALDI-MSI kullanan ikinci moleküllerin kapsamlı ardışık analizi için sağlam ve tekrarlanabilir bir protokol sunmaktadır. Optimizasyon süreci, soğuk metanolde seri yıkamayı tanımlayan çoklu organik çözücülerin test edilmesini ve ardından N-glikan analizi için en uygun kloroformun takip edilmesini içeriyordu. Bu optimize edilmiş protokolü MALDI-MSI iş akışlarına entegre etmek, hem verimliliği hem de güvenilirliği artıran, aynı doku bölümleri içindeki lipidlerin (çift polarite modunda), N-glikanların ve triptik peptidlerin kapsamlı ardışık analizini sağladı. Çeşitli kemirgen beyin dokusu örnekleri arasında doğrulama, protokolün sağlamlığını ve çok yönlülüğünü doğruladı. Optimize edilmiş metodoloji daha sonra bir transgenik Alzheimer hastalığı (AD) fare modeline (tgArcSwe) bir kavram kanıtı olarak uygulandı. AD modelinde, çeşitli sfingolipid ve gliserofosfolipid türlerinde ve özellikle serebral kortekste biantenary ve GlcNAc-bisecting N-glikanlarında önemli moleküler değişiklikler gözlenmiştir. Bu bölgeye özgü değişiklikler potansiyel olarak amiloid-beta (Abeta) plak birikimi ile ilişkilidir ve bu da bilişsel ve hafıza bozukluklarına katkıda bulunabilir. Önerilen standartlaştırılmış metodoloji, nörobiyolojik araştırmalarda önemli bir ilerlemeyi temsil eder, hastalık mekanizmalarına değerli bilgiler sağlar ve potansiyel preklinik uygulamaların temelini oluşturur. Tanısal biyobelirteçlerin ve AD ve Parkinson hastalığı gibi diğer nörodejeneratif hastalıklar için hedeflenen tedavilerin geliştirilmesine yardımcı olabilir.

Özgün kaynak özetini okuyun

Multiomics analysis of single tissue sections using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) provides comprehensive molecular insights. However, optimizing tissue sample preparation for MALDI-MSI to achieve high sensitivity and reproducibility for various biomolecules, such as lipids, N-glycans, and tryptic peptides, presents a significant challenge. This study introduces a robust and reproducible protocol for the comprehensive sequential analysis of the latter molecules using MALDI-MSI in fresh-frozen rodent brain tissue samples. The optimization process involved testing multiple organic solvents, which identified serial washing in ice-cold methanol, followed by chloroform as optimal for N-glycan analysis. Integrating this optimized protocol into MALDI-MSI workflows enabled comprehensive sequential analysis of lipids (in dual polarity mode), N-glycans, and tryptic peptides within the same tissue sections, enhancing both the efficiency and reliability. Validation across diverse rodent brain tissue samples confirmed the protocol's robustness and versatility. The optimized methodology was subsequently applied to a transgenic Alzheimer's disease (AD) mouse model (tgArcSwe) as a proof of concept. In the AD model, significant molecular alterations were observed in various sphingolipid and glycerophospholipid species, as well as in biantennary and GlcNAc-bisecting N-glycans, particularly in the cerebral cortex. These region-specific alterations are potentially associated with amyloid-beta (Aβ) plaque accumulation, which may contribute to cognitive and memory impairments. The proposed standardized methodology represents a significant advancement in neurobiological research, providing valuable insights into disease mechanisms and laying the foundation for potential preclinical applications. It could aid the development of diagnostic biomarkers and targeted therapies for AD and other neurodegenerative diseases, such as Parkinson's disease.

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.