NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
AmaçBu çalışmanın amacı, kolorektal kanser (CRC) için terapötik ve prognostik belirteçler olarak bir grup kromatin yeniden şekillendirici protein olan mikrorchidia (MORC) ailesinin rolünü incelemektir.BackgroundMORC protein ailesi genleri, üyeleri ortak bir alanı paylaşan ancak farklı biyolojik işlevlere sahip oldukça korunmuş bir nükleoprotein süper ailesidir. Önceki çalışmalar, MORC'ların epigenetik düzenleyiciler ve kromatin remodülatörleri olarak rollerini analiz etmiştir; ancak, MORC'ların CRC'nin gelişimi ve patogenezine katılımı daha az incelenmiştir.ObjektifMorkların CRC için terapötik ve prognostik belirteçler olarak rolünü inceledi.MetodlarMork ailesi genlerinin CRC'deki ifadeleri ve prognostik önemi araştırıldı. Bu genlerin tümör bağışıklığındaki rolü, bağışıklık hücresi infiltrasyonu, tümör mikroçevresi (TME) ve bağışıklık baskılayıcı genler, bağışıklık kontrol noktaları ve immünostimülatör genler gibi bağışıklık düzenleyici genlerle olan etkileşimleri açısından kapsamlı bir şekilde analiz edilmiştir. R istatistiksel yazılımı kullanılarak MORC aile genleri, tümör mutasyon yükü (TMB), DNA, uyumsuzluk onarımı (MMR), RNA metilasyonu, mikrosatellit kararsızlığı (MSI) ve ilaç duyarlılığı arasındaki ilişkiler araştırılmıştır. 150 CRC dokusunda ve 60 parakanser dokusunda MORC4'ün ifadeleri immünohistokimyasal yöntemle tespit edildi. CRC hücre proliferasyonu, göç ve istila, hücre sayma kiti-8 (CK-8), çizik tahlili ve transwell hücre istilası tahlili ile ölçüldü.SonuçlarMoRC2 ve MORC4'ün ifadeleri önemli ölçüde yükseltildi, oysa MORC1 ve MORC3'ün ifadeleri normal kolorektal mukozal dokulardaki ifadelerine kıyasla CRC'de belirgin bir şekilde azaldı. Yüksek ekspresyonlu MORC2 hastaları, düşük MORC2 seviyesine sahip olanlardan daha olumsuz bir prognoz gösterdi. Fonksiyonel anotlama analizi diyabetik kardiyomiyopati, amyotrofik lateral skleroz, oksidatif fosforilasyon, Huntington hastalığı, termogenez, Parkinson hastalığı, koku transdüksiyonu, Alzheimer hastalığı, prion hastalığı ile en önemli negatif veya pozitif korelasyona sahip 100 MORC aile genini tanımladı. MORC3 ifadesi Stromal skoru, Bağışıklık skoru ve Etimate skoru ile pozitif korelasyon gösterirken, MORC2 ekspresyonu CRC'deki üç puanla negatif korelasyon gösterirken, bu korelasyonlar istatistiksel olarak anlamlı değildi. Ek olarak, MORC aile genleri T yardımcı hücreleri gibi tümöre sızan bağışıklık hücreleri ile önemli ölçüde olumlu bir şekilde ilişkiliydi ve CXCR4 ve PVR gibi bazı immünsüpresif genlerle, TGFBR1, KDR ve CD160 gibi immünostimülatör genlerle yakın ilişkiler sergiledi. MORC aile genlerinin bazı üyelerinin ifadelerinin CRC'de DNA metilasyonu, MSI, TMB, MMR'ler ve ilaç duyarlılığı ile pozitif olarak ilişkili olduğu ve MORC4'ün mRNA ve protein seviyelerinin bitişik normal dokulara kıyasla CRC dokularında belirgin bir şekilde yükseldiği bulunmuştur (PConclusionMoRC aile genlerinin ifadeleri, prognozdaki bağışıklık hücresi ile ilişkili olan CRC örneklerinde önemli ölçüde farklıydı. Bu nedenle, MORC aile genleri, CRC'nin klinik immünoterapisini ve prognostik sonucunu gösteren belirteçler olarak kabul edildi.
Özgün kaynak özetini okuyun
AimThe aim of this study is to examine the role of the microrchidia (MORC) family, a group of chromatin remodeling proteins, as the therapeutic and prognostic markers for colorectal cancer (CRC).BackgroundMORC protein family genes are a highly conserved nucleoprotein superfamily whose members share a common domain but have distinct biological functions. Previous studies have analyzed the roles of MORCs as epigenetic regulators and chromatin remodulators; however, the involvement of MORCs in the development and pathogenesis of CRC was less examined.ObjectiveThe current work examined the role of the MORCs as the therapeutic and prognostic markers for CRC.MethodsThe expressions and prognostic significance of MORC family genes in CRC were explored. The role of these genes in tumor immunity was comprehensively analyzed in terms of their functions in immune cell infiltration, tumor microenvironment (TME), and their interaction with immune regulatory genes such as immunosuppressive genes, immune checkpoints and immunostimulatory genes. The relations between MORC family genes, tumor mutation burden (TMB), DNA, mismatch repair (MMR), RNA methylation, microsatellite instability (MSI), and drug sensitivity were investigated using the R statistical software. The expressions of MORC4 in 150 CRC tissues and 60 paracancer tissues were detected by immunohistochemical method. CRC cell proliferation, migration, and invasion were measured by cell counting kit-8 (CCK-8), scratch assay, and transwell cell invasion assay.ResultsThe expressions of MORC2 and MORC4 were significantly upregulated, whereas those of MORC1 and MORC3 were noticeably downregulated in CRC in comparison to their expressions in normal colorectal mucosal tissues. Patients with high-expressed MORC2 showed a more unfavorable prognosis than those with a low MORC2 level. Functional annotation analysis identified 100 MORC family genes with the most significant negative or positive correlations to diabetic cardiomyopathy, amyotrophic lateral sclerosis, oxidative phosphorylation, Huntington's disease, thermogenesis, Parkinson's disease, olfactory transduction, Alzheimer's disease, prion disease. MORC3 expression was positively correlated with Stromal score, Immune score and ESTIMATE score, while MORC2 expression was negatively related to the three scores in CRC, these correlations were not statistically significant. Additionally, the MORC family genes were significantly positively correlated with tumor-infiltrating immune cells such as T helper cells and exhibited close relations to some immunosuppressive genes such as CXCR4 and PVR, immunostimulatory genes such as TGFBR1, KDR, and CD160 as well as some immune checkpoint genes. It was found that the expressions of some members of MORC family genes were positively correlated with DNA methylation, MSI, TMB, MMRs, and drug sensitivity in CRC and that the mRNA and protein levels of MORC4 were remarkably upregulated in CRC tissues than in adjacent normal tissues (PConclusionThe expressions of MORC family genes were significantly different in CRC samples, which was related to the immune cell infiltration and prognosis of CRC. Thus, the MORC family genes were considered as markers for indicating the clinical immunotherapy and prognostic outcome of CRC.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.