NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Amino asit dizisi tarafından belirlenen geleneksel protein yapısı modeli, bugün, insan proteomunun yaklaşık yarısının kısmen veya tamamen kararlı bir 3D yapıya sahip olmayan proteinlerden oluştuğu gerçeğiyle ciddi bir şekilde karşı karşıyadır. İçsel olarak düzensiz proteinler (IDP'ler) olarak adlandırılan bu proteinler, çok sayıda fizyolojik fonksiyonda yer alır ve ciddi patolojilerle ilişkilidir, örneğin. Alzheimer, Parkinson, Creutzfeldt-Jakob, amyotrofik lateral skleroz (ALS) ve tip 2 diyabet. Bu proteinleri hedeflemek iki nedenden dolayı zordur: i) fizyolojik işlevlerini korumamız gerekir ve ii) güvenilir başlangıç koşullarının olmaması nedeniyle moleküler kenetlenme ile ilaç tasarımı mümkün değildir. Bu zorlukla karşı karşıya kalan AlphaFold gibi yapay zeka (AI) tarafından önerilen çözümler açıkça uygun değildir. Bunun yerine, kısa sentetik peptidlerde, IDP'lerin konformasyonel esnekliğini taklit etmekten oluşan yenilikçi bir yaklaşım önermekteyiz. adaptif peptidler dediğimiz bu peptidler, bir ligand ile etkileşime girdikten sonra yapılandırılan IDP'lerin etki alanlarından türemiştir. Adaptif peptidler, IDP'lerin zararlı etkilerini doğrudan hedeflemeden, ancak seçilen ligandlar aracılığıyla fizyolojik özelliklerini etkilemeden seçici olarak antagonize etmek amacıyla tasarlanmıştır. Bu "hedefi hedefle, oku değil" stratejisinin, şu anda ilaçsız proteinler için ilaç keşfine yeni bir yol açacağına söz verilir.
Özgün kaynak özetini okuyun
The traditional model of protein structure determined by the amino acid sequence is today seriously challenged by the fact that approximately half of the human proteome is made up of proteins that do not have a stable 3D structure, either partially or in totality. These proteins, called intrinsically disordered proteins (IDPs), are involved in numerous physiological functions and are associated with severe pathologies, e.g. Alzheimer, Parkinson, Creutzfeldt-Jakob, amyotrophic lateral sclerosis (ALS), and type 2 diabetes. Targeting these proteins is challenging for two reasons: i) we need to preserve their physiological functions, and ii) drug design by molecular docking is not possible due to the lack of reliable starting conditions. Faced with this challenge, the solutions proposed by artificial intelligence (AI) such as AlphaFold are clearly unsuitable. Instead, we suggest an innovative approach consisting of mimicking, in short synthetic peptides, the conformational flexibility of IDPs. These peptides, which we call adaptive peptides, are derived from the domains of IDPs that become structured after interacting with a ligand. Adaptive peptides are designed with the aim of selectively antagonizing the harmful effects of IDPs, without targeting them directly but through selected ligands, without affecting their physiological properties. This "target the target, not the arrow" strategy is promised to open a new route to drug discovery for currently undruggable proteins.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.