A change language for ontologies and knowledge graphs.

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Ontolojiler ve bilgi grafikleri (KGS), insan anatomisi gibi bazı alanların genel amaçlı hesaplanabilir temsilleridir ve sıklıkla modern bilgi sistemlerinin önemli bir parçasıdır. Bu yapıların çoğu zamanla değişir, daha önce eksik olan yeni bilgi veya bilgileri içerir. Bu değişiklikleri yönetmek, hem kullanıcılara değişiklikleri iletmek hem de birden fazla paydaşın katkıda bulunmasını kolaylaştırmak için mekanizmalar sağlamak açısından bir zorluktur. Bu ihtiyacı karşılamak için, KGCL, Bilgi Grafiği Değişim Dili (https://github.com/INCATools/kgcl), KG'lerde ve ontolojilerde yapılan değişiklikleri yüksek düzeyde tanımlamak için standart bir veri modeli ve buna eşlik eden bir insan tarafından okunabilir Kontrollü Doğal Dil (CNL) oluşturduk. Bu dil iki amaca hizmet eder: bir küratör, istenen değişiklikleri talep etmek için kullanabilir ve ayrıca, metin belgeleri ve bilgisayar programlarındaki değişiklikleri yönetmek için yaygın olarak kullanılan "uygulama yaması" ve "zor" kavramlarına karşılık gelen, daha önce meydana gelen değişiklikleri tanımlamak için de kullanılabilir. KGCL'nin bir diğer önemli özelliği, tanımlamaların yararlı olacak kadar yüksek seviyede olması ve çeşitli paydaşlar tarafından anlaşılabilmesidir - örneğin ontoloji düzenlemeleri, "önlem"e eş anlamlı 'kol' eklemek" veya "nörodejeneratif hastalık altında 'Parkinson hastalığı' taşımak" gibi komutlarla belirtilebilir. Ayrıca ontoloji değişikliklerini yönetmek için bir takım araçlar inşa ettik. Bunlar, GitHub ontoloji depolarıyla entegre olan ve izleyen otomatik bir ajan ve kullanıcıların BioPortal kullanıcı arayüzünden doğrudan değişiklik istekleri yapmalarını sağlayan BioPortal ontoloji kaynağındaki istenen değişiklikleri ve yeni bir bileşeni uygular. Genel olarak, KGCL veri modeli, CNL ve ilişkili araç, ontolojilerin ve KG'lerin gelişimi ile ilişkili değişikliklerin daha kolay yönetilmesine ve işlenmesine olanak tanır. Veritabanı URL: https://github.com/INCATools/kgcl.

Özgün kaynak özetini okuyun

Ontologies and knowledge graphs (KGs) are general-purpose computable representations of some domain, such as human anatomy, and are frequently a crucial part of modern information systems. Most of these structures change over time, incorporating new knowledge or information that was previously missing. Managing these changes is a challenge, both in terms of communicating changes to users and providing mechanisms to make it easier for multiple stakeholders to contribute. To fill that need, we have created KGCL, the Knowledge Graph Change Language (https://github.com/INCATools/kgcl), a standard data model for describing changes to KGs and ontologies at a high level, and an accompanying human-readable Controlled Natural Language (CNL). This language serves two purposes: a curator can use it to request desired changes, and it can also be used to describe changes that have already happened, corresponding to the concepts of "apply patch" and "diff" commonly used for managing changes in text documents and computer programs. Another key feature of KGCL is that descriptions are at a high enough level to be useful and understood by a variety of stakeholders-e.g. ontology edits can be specified by commands like "add synonym 'arm' to 'forelimb'" or "move 'Parkinson disease' under 'neurodegenerative disease'." We have also built a suite of tools for managing ontology changes. These include an automated agent that integrates with and monitors GitHub ontology repositories and applies any requested changes and a new component in the BioPortal ontology resource that allows users to make change requests directly from within the BioPortal user interface. Overall, the KGCL data model, its CNL, and associated tooling allow for easier management and processing of changes associated with the development of ontologies and KGs. Database URL: https://github.com/INCATools/kgcl.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.