NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
GirişMetabolik sendrom (MetS) ve Parkinson hastalığı (PD) MetS hastalarında yüksek PD insidansı ile ilgili ortak patofizyolojik ve moleküler bozuklukları paylaşır. Bu çalışmada, PD hastalarında bağımsız olarak MetS ile ilişkili tek nükleotitli polimorfizm varyantlarını (SNV'ler) aradık ve ilgili moleküler mekanizmayı açıklamayı amaçladık.MetodlarPozitron emisyon tomografisi (PET) tanısı konan 423 PD hastasını dahil ettik. Bir lojistik regresyon modeli, chi-kare analizi ve Fisher'ın kesin testi, Parkinson'un İlerleme İşaretçisi Girişimi (PPMI) veritabanından elde edilen verilerin katkılı, baskın ve çekinik genetik modellerine uygulandı. MikroRNA Kantitatif özellik Loci (MirQTL) analizi ve 5'/3'- çevrilmemiş bölgelere (UTR) ve konding sekansına (CDS) bağlanan mikroRNA gen tahmini analizi yapıldı. Moleküler mekanizmaları değerlendirmek için nicel özellik loci haritalama (eQTL) ve ağırlıklı eş-ifade ağ analizi kullanılarak gen önceliklendirme kullanıldı. İfade özelliklerindeki varyansı açıklayan kromozomal lokus eQTLs olarak adlandırılır.SonuçlarSNV varyantı rs1803274 MetS, artmış kardiyovasküler risk ve değiştirilmiş bütirilkolinesteraz seviyeleri ile ilişkiliydi. BuChe 3'/'5-UTR ve CDS bölgesine bağlanan on bir mikroRNA, ifadesini azalttı. Rs1803274 varyantı, nörotransmitter açıklığı, ghrelin salgılanması ve deasilasyon, fosfatidilkolin sentezi, gliserosfolipid ve lipid metabolizması ve sinaptik iletim için önemli ölçüde zenginleştirilmiştir. Kırk altı eQTL proteini SNV rs1803274 ile ilişkilendirilmiştir. Bunların on üçü düğüm derecesi parametreleri, aradaki uzaklık merkeziliği ve yakınlık merkeziliğine dayalı ana bileşen analizinde potansiyel terapötik hedefler olarak önceliklendirildi.Katılım ve yorumSNV varyantı rs1803274 hem MetS hem de PD ile ilişkiliydi ve ghrelin hidrolizinde yer alan BuChe ifadesini azalttı. Bu varyant, birkaç MetS ile ilişkili eQTL proteini veya bileşenleri ile ilişkilendirilmiştir.
Özgün kaynak özetini okuyun
IntroductionMetabolic syndrome (MetS) and Parkinson's disease (PD) share common pathophysiological and molecular impairments related to high PD incidence in MetS patients. In this study, we searched for independently MetS-associated single-nucleotide polymorphism variants (SNVs) in PD patients and aimed to explain the molecular mechanism involved.MethodsWe included 423 PD patients diagnosed by positron emission tomography (PET). A logistic regression model, the chi-squared analysis, and Fisher's exact test were applied to additive, dominant, and recessive genetic models of data obtained from the Parkinson's Progression Marker Initiative (PPMI) database. MicroRNA Quantitative trait Loci (MirQTL) analysis and microRNA binding to 5'/3'- untranslated regions (UTR) and conding sequence (CDS) region gene prediction analysis were performed. Expression quantitative trait loci mapping (eQTL) and gene prioritization using weighted co-expression network analysis were used to evaluate the molecular mechanisms. Chromosomal loci that explain variance in expression traits are referred to as eQTLs.ResultsThe SNV variant rs1803274 was associated with MetS, increased cardiovascular risk, and altered butyrylcholinesterase levels. Eleven microRNAs binding to the BuChe 3'/'5-UTR and CDS region downregulated its expression. The rs1803274 variant was significantly enriched for neurotransmitter clearance, ghrelin secretion and deacylation, phosphatidylcholine synthesis, glycerophospholipid and lipid metabolism, and synaptic transmission. Forty-six eQTL proteins were associated with the SNV rs1803274. Thirteen of these were prioritized as potential therapeutic targets in a principal component analysis based on node degree parameters, betweenness centrality, and closeness centrality.Conclusion and interpretationThe SNV variant rs1803274 was associated with both MetS and PD and downregulated the expression of BuChe, which is involved in ghrelin hydrolysis. This variant was associated with several MetS-related eQTLs proteins or their components.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.