NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
GirişTek-omik çalışmalar, hastalıkla ilgili moleküler süreçler hakkındaki anlayışımızı derinleştirdi, ancak çapraz sistem etkileşimlerini ortaya çıkarmak için entegre yaklaşımlara ihtiyaç duyulmaktadır. Daha önce Parkinson hastalığında (PD) serum metabolom ve bağırsak mikrobiyomunda değişiklikler olduğunu bildirdik. Bu bulguların üzerine inşa etmek için, PD.Methods'taki bağırsak mikrobiyomu ile insan metabolizması arasındaki etkileşimi incelemek için çok omikli bir entegrasyon analizi yaptık.Kırsal Kaliforniya'dan 113 PD hastasının topluluk temelli bir çalışmasında, mikrobiyom profilleri, dışkı örneklerinin 16S rRNA gen dizilemesi yoluyla elde edildi. Serum metabolomik profiller hedefsiz yüksek çözünürlüklü LC-MS kullanılarak oluşturulmuştur. Metabolom verilerinin artık matrisleri yaş, cinsiyet, ırksal azınlık durumu ve çalışma dalgasına göre ayarlandıktan sonra çıkarıldı. PD ile ilişkili bakteriyel cinsleri tanımladık ve ana bileşen analizini kullanarak bolluklarını özetledik. Bu özet skorunu bağımlı değişken olarak kullanarak, PD ile ilişkili bağırsak mikrobiyomu ile ilişkili serum metabolitlerini tanımlamak için kısmi en az kare (PLS) regresyonunu gerçekleştirdik. Pathway zenginleştirme analizi daha sonra PLS modelinden seçilen metabolit özellikleri üzerinde yapılmıştır.SonuçlarPD ile ilişkili mikroplarla ilişkili 266 metabolit özelliği ve anotlanmış 29 metabolik bileşik tespit ettik (p SonuçÇok omik entegrasyon analizimiz PD ile ilişkili bağırsak mikrobiyotasının konak lipid metabolizması, bağışıklıkla ilişkili yollar ve potansiyel olarak kynurenin yol metabolizmasının B vitamini aracılı düzenlenmesinde yer aldığını ortaya koydu, potansiyel mikrobiyometabolizdeki etkileşimler.
Özgün kaynak özetini okuyun
IntroductionSingle-omics studies have deepened our understanding of disease-related molecular processes, though integrated approaches are needed to uncover cross-system interactions. We previously reported changes in the serum metabolome and gut microbiome in Parkinson's disease (PD). To build on these findings, we conducted a multi-omics integration analysis to examine the interplay between the gut microbiome and human metabolism in PD.MethodsIn a community-based study of 113 PD patients from rural California, microbiome profiles were obtained via 16S rRNA gene sequencing of fecal samples. Serum metabolomic profiles were generated using untargeted high-resolution LC-MS. Residual matrices of metabolomics data were extracted after adjusting for age, sex, racial minority status, and study wave. We identified PD-associated bacterial genera and summarized their abundance using principal component analysis. Using this summary score as the dependent variable, we performed partial least squares (PLS) regression to identify serum metabolites associated with the PD-related gut microbiome. Pathway enrichment analysis was then conducted on selected metabolite features from the PLS model.ResultsWe identified 266 metabolite features and annotated 29 metabolic compounds associated with PD-related microbes (p ConclusionOur multi-omics integration analysis revealed that PD-associated gut microbiota are involved in host lipid metabolism, immune-related pathways, and potentially vitamin B-mediated regulation of kynurenine pathway metabolism, providing insights into potential microbiome-metabolome interactions in PD pathophysiology.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.