Long-read sequencing identifies <i>FGF14</i> repeat expansions in Parkinson’s disease

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

FGF14'teki patojenik GAA tekrar genişlemeleri, geç başlangıçlı serebellar ataksisinin yerleşik bir nedenidir, ancak Parkinson hastalığı (PD) ile bağlantılı değildir. RFC1 gibi ataksi ile ilişkili genlerdeki genişlemelerin, PD'nin atipik veya ailesel formlarına katkıda bulunabileceğine dair ortaya çıkan kanıtlar göz önüne alındığında, FGF14 genişlemelerinin benzer bir rol oynayabileceğini araştırdık. PPMI kohortundan PD ve 197 nörolojik açıdan sağlıklı kontrole sahip 411 birey üzerinde uzun okunan tüm genom dizilimini kullanarak, NIH CARD girişiminin 1.429 ek kontrolü, 1000 Genom Projesi ve Küresel olarak farklı popülasyonları temsil eden All of Us programı. Patojenik FGF14 GAA tekrar genişlemelerini PD ve bir kontrole sahip beş bireyde belirledik. Her beş birey de PD'nin klinik kriterlerine uyuyor ve DaTSCAN görüntülemesinde tipik nörodejenerasyon kalıpları gösterdi; alfa-sinüklein agregasyonu, mevcut verilere sahip dört birey arasında pozitif tohumlama testi ile doğrulandı. Bu bulgular FGF14 tekrar ilişkili hastalığın fenotipik spektrumunu genişletir ve PD'ye nadir, daha önce tanınmayan bir genetik katkı olduğunu öne sürer. Bilgimize göre, bu, FGF14'ü PD'de içeren ilk rapordur ve çözülmemiş vakalarda patojenik varyasyonun gizli biçimlerini tespit etmek için uzun okuma diziliminin yararlılığının altını çizmektedir.

Özgün kaynak özetini okuyun

Pathogenic GAA repeat expansions in FGF14 are an established cause of late-onset cerebellar ataxia, but have not been linked to Parkinson’s disease (PD). Given emerging evidence that repeat expansions in ataxia-associated genes like RFC1 , can contribute to atypical or familial forms of PD, we investigated whether FGF14 expansions might play a similar role. Using long-read whole-genome sequencing on 411 individuals with PD and 197 neurologically healthy controls from the PPMI cohort, alongside 1,429 additional controls from the NIH CARD initiative, the 1000 Genomes Project, and the All of Us program, representing globally diverse populations. We identified pathogenic FGF14 GAA repeat expansions in five individuals with PD and one control. All five individuals fit the clinical criteria of PD and showed typical patterns of neurodegeneration on DaTSCAN imaging; α-synuclein aggregation was confirmed by a positive seeding assay among four individuals with available data. These findings broaden the phenotypic spectrum of FGF14 repeat-associated disease and suggest a rare, previously unrecognized genetic contributor to PD. To our knowledge, this is the first report implicating FGF14 in PD and underscores the utility of long-read sequencing for detecting hidden forms of pathogenic variation in unresolved cases.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.