Probing the proteome-wide impact of inhibitors of Leucine-rich Repeat Kinases 1 and 2 on protein-protein interactions and phosphorylation

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by

Leucine açısından zengin tekrar kinaz 1 ve 2 (LRRK1 ve 2), Roco protein ailesinin büyük, çok alanlı proteinleri ve yakından ilişkili üyeleridir. Etki alanı yapısında yüksek bir benzerliği paylaşırlar ve her ikisi de Rab GTPaz ailesinin fosforilat üyeleridir. Bununla birlikte, bu benzerliklere rağmen, iki kinaz arasında önemli farklılıklar vardır. LRRK1'e mutasyonlar sadece nadir osteopetroz vakalarında dahil edilirken, LRRK2, en belirgin olarak Parkinson hastalığının ailesel ve sporadik formları ile ilişkili olup, patojenik LRRK2'nin artmış kinaz aktivitesi ile ilişkilidir. LRRK2, araştırma topluluğundan büyük ilgi görürken, LRRK1 büyük ölçüde incelenmiştir. Bu çalışmada, LRRK1 ve LRRK2'nin hücresel etkileşimlerini ve ilgili fosforilasyon alanlarını elde etmek için bir model hücre hattında nicel fosfoproteomik ile birlikte yakınlık etiketleme kütle spektrometrisi kullanıyoruz. Daha sonra bu veri kümesini, hem LRRK1 hem de 2'yi hedefleyen küçük moleküllerin etkisini karakterize etmek için kullanırız. Bu inhibitörlerden etkilenen proteomdaki fosforilasyon bölgelerini tanımlıyoruz ve MICALL2 de dahil olmak üzere LRRK2 için yeni aday substratları tanımlıyoruz. Verilerimiz bir araya getirilerek LRRK proteinlerinin hücresel rolü ve işlevi ve bunların terapötik hedefler olarak potansiyel kullanımı üzerine gelecekteki çalışmalar için güçlü bir kaynak sağlar.

Özgün kaynak özetini okuyun

The Leucine-rich repeat kinases 1 and 2 (LRRK1 and 2) are large, multidomain proteins and closely related members of the Roco protein family. They share a high similarity in domain structure and are both phosphorylate members of the Rab GTPase family. However, despite these similarities, there are substantial differences between the two kinases. While mutations to LRRK1 are only implicated in rare cases of osteopetrosis, LRRK2 is associated with multiple diseases, most prominently with familial and sporadic forms of Parkinson’s disease, where pathogenic LRRK2 is associated with an increased kinase activity. While LRRK2 has received major attention from the research community, LRRK1 has been largely understudied. In this work, we employ proximity labelling mass spectrometry in combination with quantitative phosphoproteomics in a model cell line to obtain the cellular interactomes of LRRK1 and LRRK2 and corresponding phosphorylation sites. We then use this dataset to characterize the impact of small molecules targeting both LRRK1 and 2. We identify phosphorylation sites across the proteome that are impacted by these inhibitors and identify novel candidate substrates for LRRK2, including MICALL2. Taken together our data provide a powerful resource for future studies on the cellular role and function of LRRK proteins and their potential use as therapeutic targets.

Bilimsel değerlendirme

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.