Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Genişletilmiş kısa tandem tekrarları geniş bir nörodejeneratif hastalık yelpazesine katkıda bulunur, ancak Parkinson hastalığı (PD) ve parkinsonizmdeki rolleri, özellikle çeşitli ansestrlerde eksik karakterize kalır. 38.365 bireyden (28.861 WGS; 9,504 CES) 23.242 hasta ile PD, 4,729 atipik parkinsonizm hastası ve 11 genetik ansestrden 10,394 sağlıklı kontrol içeren kısa okumalı tüm genom (WGS) ve klinik exome sekanslama (CES) verilerini analiz ettik. Taşıyıcı frekansları belirlemek ve çeşitli ansestler boyunca tekrarlanan yapıları karakterize etmek için, normal, ara ve patojenik alellerin kısa okuma dizileme verileri kullanılarak güvenilir bir şekilde ayırt edilebileceği 12 yerleşik patojenik lokusu genotipledik. Buna ek olarak, 15.995 bireyde PD riskinin artmasıyla ilişkili minimum eşik eşiğini belirlemek için eşik tabanlı dernekler yürüttük (8.591 PD, 7.404 kontrol). Patojenik tekrar genleşmeleri 62 hastada (56 PD ve 6 atipik parkinsonizm) ve yedi lokus (AR, ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, HTT ve THAP11) boyunca 5 kontrolde tespit edildi. Bunlar arasında, ATXN2 genişlemeleri PD'de en sık gözlenen ve Afrika, Doğu Asya, Avrupa ve Orta Doğu ansestlerinde mevcuttu. Ek olarak, orta ATXN2 tekrar genişlemeleri, Avrupa popülasyonunda PD riski ile güçlü, uzunluğa bağlı bir ilişki sergiledi; 32 sterlinlik bireyler, dört kattan fazla artmış bir riske sahip oldu (ods oranı 4.25,% 95 güven aralığı 1.80-12.05). Genel olarak, genişletilmiş alellerin %92'si CAG kanalı içinde CAA kesintilerini barındırır. ATXN3 ve THAP11 gibi diğer lokuslardaki patojenik genişlemeler, atalara özgü dağılımları daha fazla göstermiştir. Klinik olarak, patojenik ATXN2 ve ATXN3 genişlemeleri olan bireyler en sık tipik PD özellikleri ile sunuldu, ancak sıklıkla daha erken hastalık başlangıcı ve güçlü bir aile öyküsü gösterdi. Bu büyük ölçekli, çok atalı çalışma, PD'deki patojenik ve ara tekrar genişlemelerin genetik manzarasını kapsamlı bir şekilde haritalamaktadır. Bulgularımız, ATXN2 için Avrupa popülasyonunda PD ile uzunlamasına ve yapıya bağımlı bir risk birliğini doğruluyor ve parkinson spektrumu boyunca tekrar eden genişlemelerin pleiotropik etkilerini vurguluyor.
Özgün kaynak özetini okuyun
Expanded short tandem repeats contribute to a broad spectrum of neurodegenerative diseases, yet their roles in Parkinson’s disease (PD) and parkinsonism remain incompletely characterized, especially across diverse ancestries. We analyzed short-read whole-genome (WGS) and clinical exome sequencing (CES) data from 38,365 individuals (28,861 WGS; 9,504 CES), encompassing 23,242 patients with PD, 4,729 patients with atypical parkinsonism and 10,394 healthy controls from 11 genetic ancestries. To determine carrier frequencies and characterize repeat structures across diverse ancestries, we genotyped 12 established pathogenic loci where normal, intermediate, and pathogenic alleles can be reliably differentiated using short-read sequencing data. Additionally, we conducted threshold-based associations to determine the minimum threshold associated with increased PD risk in 15,995 individuals (8,591 PD, 7,404 controls) of European ancestry. Pathogenic repeat expansions were detected in 62 patients (56 PD and 6 atypical parkinsonism) and 5 controls across seven loci ( AR , ATXN1 , ATXN2 , ATXN3 , CACNA1A , HTT and THAP11 ), spanning seven ancestries. Among these, ATXN2 expansions were the most frequently observed in PD and were present in African, East Asian, European and Middle Eastern ancestries. Additionally, intermediate ATXN2 repeat expansions exhibited a strong, length-dependent association with PD risk in the European population, with individuals with ≥32 repeats having a more than four-fold increased risk (odds ratio 4.25, 95% confidence interval 1.80-12.05). Overall, >92% of expanded alleles harbor CAA interruptions within the CAG tract. Pathogenic expansions at other loci, such as ATXN3 and THAP11 , showed more ancestry-specific distributions. Clinically, individuals with pathogenic ATXN2 and ATXN3 expansions most often presented with typical PD features but frequently showed earlier disease onset and a strong family history of PD. This large-scale, multi-ancestry study comprehensively maps the genetic landscape of pathogenic and intermediate repeat expansions in PD. Our findings confirm a length- and structure-dependent risk association for ATXN2 with PD in the European population and highlight the pleiotropic effects of repeat expansions across the parkinsonian spectrum.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.