NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Özet Arka plan Parkinson hastalığı, hastalığı değiştiren bir tedavi ve Levodopa (L-dopa) gibi mevcut ilaçların uzun süreli kullanımı zayıflatıcı yan etkilere neden olmadan küresel bir sağlık tehdidi oluşturmuştur. Bu çalışma, bazı Safflower bitki fitokimyasallarının ilaç benzerliğini ve farmakokinetiğini potansiyel terapötikler olarak araştırmak için in-siliko yaklaşımını benimsemeye odaklandı. 120 fitokimyasaltan (Saffflower tesisinin farklı bölümlerinden) oluşan elle kürlenmiş bir kütüphane, ilk olarak SwissADME sunucusunu kullanarak Lipinski'nin 5 kuralına bağlı kalmak için sanal olarak tarandı. Bağlama etkileşimleri Discovery Studio Visualizer kullanılarak incelenmiştir. Siteye özgü kenetlenme AutoDock Vina kullanılarak gerçekleştirildi ve kenetlenme parametreleri Standart ilacın puanına göre ayarlandı. Bağlantı puanları Mcule sunucusu tarafından doğrulandı. ADMET (Adsorpsiyon, dağılım, metabolizma, atılım ve toksisite) özellikleri swissadme kullanılarak tahmin edilirken, karsinojenlik ve toksisite sırasıyla CarcinoPred-EL ve PkCSM araçları kullanılarak tahmin edildi. Reseptör ve protein – ligand komplekslerinin stabilitesini tahmin etmek için 200ns için GROMACS'de MD (Moleküler dinamik) simülasyonları gerçekleştirildi. Sonuçlar Sekiz bileşik; Serotobenin, Kaempferol, Nb-PCoumaroyltryptamine, N-Coumaroyl Serotonin, N-Feroloylserotonin, Scutellarein, Acacetin ve Trans-Chalcone LRRK2'nin potansiyel inhibitörleri olarak tanımlanmıştır. Moleküler dinamikler C1B (N-Coumaroyl-Serotonin) bileşiğine moleküler tanımada C4B (Serotobenine) bileşiğinden daha fazla stabilite gösterir. Sonuç Safflower'da tespit edilen bileşiklerin bazıları, kaydedilen düşük bağlanma enerjisi ve hedefteki stabiliteleri nedeniyle, mutant LRRK2 (Leucine-zengin tekrar kinaz 2) nedeniyle Parkinson hastalığının tedavisi için ilaç adayı olma potansiyeline sahiptir.
Özgün kaynak özetini okuyun
Abstract Background Parkinson’s disease has posed a global health threat with no disease-modifying treatment and prolonged use of available drugs such as Levodopa (L-dopa) causes debilitating side effects. This study focused on adopting in-silico approach to investigate the drug likeliness and pharmacokinetics of some Safflower plant phytochemicals as potential therapeutics. A manually curated library of 120 phytochemicals (from different parts of Safflower plant) was first screened virtually for adherence to the Lipinski’s rule of 5 using the SwissADME server. Binding interactions were studied using Discovery Studio Visualizer. Site-specific docking was performed using AutoDock Vina and the docking parameters were set based on the score of Standard drug. The docking scores were validated by Mcule server. ADMET (Adsorption, distribution, metabolism, excretion and toxicity) properties were predicted using swissadme while carcinogenicity and toxicity were predicted using CarcinoPred-EL and PkCSM tools respectively. MD (Molecular dynamics) simulations were performed in GROMACS for 200ns to estimate the stability of the receptor and the protein – ligand complexes. Results Eight compounds; Serotobenine, Kaempferol, Nb-PCoumaroyltryptamine, N-Coumaroyl Serotonin, N-Feruloylserotonin, Scutellarein, Acacetin and Trans-Chalcone were identified as potential inhibitors of LRRK2 with no or mild toxicity. Molecular dynamics show more stability in molecular recognition to C1B (N-Coumaroyl-Serotonin) compound than C4B (Serotobenine). Conclusion Some of the compounds identified in the Safflower have the potential to be drug candidates for the treatment of Parkinson’s disease caused by mutant LRRK2 (Leucine-rich repeat kinase 2), owing to their recorded low binding energy and stability in the target.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.