NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Özet Bu çalışma, Salvia officinalis'in nörodejeneratif bozukluklardaki farmakolojik mekanizmasını, moleküler kenetlenme analizinin ardından bir ağ farmakoloji yaklaşımı kullanarak değerlendirmeyi amaçlamıştır. S.officinalis'in fitokonstituentleri çeşitli veritabanlarından elde edildi ve ardından İsviçre ADME web aracını kullanarak aktif bileşenlerin taranması takip edildi. Aktif bileşenlerin potansiyel hedefleri PubChem & SwissTargetPrediction kullanılarak belirlendi. Alzheimer hastalığı (AD), Parkinson hastalığı (PD) ve Huntington hastalığı (HD) ile ilgili genler çevrimiçi veritabanları kullanılarak toplandı. Ayrıca, aktif bileşen hedefleri ile hastalıkla ilişkili genler arasındaki korelasyon bağlantılıydı. Ağlar Cytoscape kullanılarak oluşturulmuş, görselleştirilmiş ve analiz edilmiştir. Gene Ontoloji (GO) ve Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome (KEGG) yol zenginleştirme analizi DAVID veritabanı kullanılarak gerçekleştirildi. Decisively, Autodock moleküler kenetlenme için kullanıldı. Ağ analizinin sonuçları, aktif bileşen - aday hedef ağının topolojik analizine dayanan 9 temel aktif bileşen tespit etti. Ayrıca, analiz, 133 AD ile ilgili hedefle etkileşime giren S. officinalis'in 9 temel aktif bileşeninin ortak bir hedefini ortaya çıkardı; oysa sırasıyla sadece 6 aktif bileşen 85 ve 58 PD ve HD hedefiyle etkileşime girdi. Ağdaki çekirdek genler AKT1, BACE1, CASP3, MAPK1, TNF ve IL6 idi. Dahası, GO ve KEGG zenginleştirme analizi, FOXO, TNF, MAPK, PI3K-Akt, Rap 1 ve nörotrofin sinyal yollarının zenginleştirilmiş olduğunu gösterdi, bu da S. officinalis'in nörodejeneratif hastalıklardaki koruyucu rolünü öne süren moleküler kenetlenme ile daha da doğrulandı. Araştırmamız, nörodejeneratif hastalıkların modülasyonunda önemli bir rol oynayabilecek S. officinalis'in terapötik faydalarını ortaya koymaktadır.
Özgün kaynak özetini okuyun
Abstract The present study aimed to assess the pharmacological mechanism of Salvia officinalis in Neurodegenerative disorders using a network pharmacology approach followed by molecular docking analysis. Phytoconstituents of S.officinalis were obtained from various databases, followed by the screening of active ingredients using the Swiss ADME web tool. Potential targets of active ingredients were identified using PubChem & SwissTargetPrediction. Genes related to Alzheimer’s disease (AD), Parkinson’s disease (PD), and Huntington’s disease (HD) were gathered using online databases. Besides, the correlation between active ingredient targets and disease-associated genes was linked. Networks were constructed, visualized, and analyzed using Cytoscape. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome (KEGG) pathway enrichment analysis were performed using DAVID database. Decisively, Autodock was used for molecular docking. The results of network analysis identified 9 key active ingredients based on topological analysis of the active ingredient - candidate targets network. Also, the analysis revealed a shared target of 9 key active ingredients of S. officinalis that interacted with 133 AD-related targets whereas only 6 active ingredients interacted with 85 and 58 targets of PD and HD respectively. The core genes from the network were AKT1, BACE1, CASP3, MAPK1, TNF, and IL6. Furthermore, GO and KEGG enrichment analysis showed that FOXO, TNF, MAPK, PI3K-Akt, Rap 1, and neurotrophin signalling pathways as enriched, which were further validated by molecular docking suggesting the protective role of S. officinalis in neurodegenerative diseases. Our research reveals the therapeutic benefits of S. officinalis, which might play a crucial role in modulating neurodegenerative diseases.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.