NeuralCipher Araştırma özeti
Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc by
Özet Nötrofil hücre dışı tuzaklar (NET'ler) önemli doğuştan gelen bağışıklık mekanizmaları sağlar ve çalışmalar doğuştan gelen bağışıklık ve adaptif bağışıklığın Parkinson hastalığı (PD) patolojisinde doğrudan bağlantılı olduğunu göstermiştir. Bununla birlikte, PD'deki NET'ler hakkında çok az çalışma vardır. PD ve Control arasında ve GSVA tarafından elde edilen yüksek ve düşük puanlı gruplar arasında diferansiyel olarak ifade edilen genler (DEG'ler) elde etmek için diferansiyel analiz uygulandı. Daha sonra, PD ve Kontrol grupları arasındaki DEG'ler, iki puan grubu arasındaki DEG'ler ve kritik modüldeki genler üst üste binen genlere ulaşmak için üst üste bindirildi. Daha sonra, biyobelirteçleri elde etmek için PPI'de beş çeşit algoritma gerçekleştirildi. Daha sonra, PD olasılığını tahmin etmek için bir nomogram oluşturuldu. Biyobelirteçlerin zenginleştirme analizi ve bağışıklık infiltrasyon analizi yapıldı. qRT-PCR, üç biyobelirteçlerin ifade eğilimlerini doğrulamak için gerçekleştirildi. PD ve Kontrol grupları arasında 798 DEG, diferansiyel analizlerle elde edilen yüksek ve düşük puanlı gruplar arasında 168 DEG olduğu gösterilmiştir. 926 gen içeren pembe modül kritik modül olarak tanımlandı. Kesişime göre, 43 üst üste binen gen görüntülendi. Ayrıca, GPR78, CADM3 ve CACNA1E biyobelirteçler olarak doğrulandı. Dahası, biyobelirteçlerin esas olarak ‘hidrojen peroksit katabolik süreç’ ve ‘hücre döngüsü’ gibi yollara katıldığını bulduk. PD ve Kontrol grupları arasında beş çeşit diferansiyel bağışıklık hücresi tespit edildi. Son olarak, qRT-PCR sonucu GPR78, CADM3 ve CACNA1E'nin PD grubunda tamamen düzenlenmiş olduğunu gösterdi. Çalışmamız, biyobelirteçlerin PD ile ilişkili olduğu için GPR78, CADM3 ve CACNA1E'yi doğrulamıştır. PD'nin teşhisi ve tedavisi için orijinal bir referans sağlar.
Özgün kaynak özetini okuyun
Abstract Neutrophil extracellular traps (NETs) provide key innate immune mechanisms, and studies have shown innate immunity and adaptive immunity are directly linked in Parkinson’s disease (PD) pathology. However, there are few studies on NETs in PD. Differential analysis was implemented to acquire differentially expressed genes (DEGs) between PD and Control, and between high- and low-score groups obtained by GSVA. Then, the DEGs between PD and Control groups, DEGs between the two score groups, and the genes in the critical module were overlapped to achieve the overlapping genes. Next, five kinds of algorithms in the PPI were performed to achieve biomarkers. Subsequently, a nomogram for forecasting PD probability was created. Enrichment analysis and immune infiltration analysis was conducted of biomarkers. qRT-PCR was performed to verify the expression trends of three biomarkers. Results shown there were 798 DEGs between PD and Control groups and 168 DEGs between high- and low-score groups obtained by differential analyses. The pink module containing 926 genes was identified as the critical module. According to the intersection, 43 overlapping genes were screened out. Furthermore, GPR78, CADM3, and CACNA1E were confirmed as biomarkers. Moreover, we found that biomarkers mainly participated in pathways, such as ‘hydrogen peroxide catabolic process’ and ‘cell cycle’. Five kinds of differential immune cells between PD and Control groups were identified. Finally, the qRT-PCR result showed that GPR78, CADM3, and CACNA1E all up-regulated in the PD group. Our study authenticated GPR78, CADM3, and CACNA1E as the biomarkers were associated with PD. It provides an original reference for the diagnosis and treatment of PD.
Bilimsel değerlendirme
Araştırma sorusu
Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.
Yöntem ve örneklem
Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.
Temel bulgular
Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.
Sınırlılıklar
Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.
Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.