SCIENTIFIC HUB

Araştırmanın izini sürün.

SCIENTIFIC LITERATURE · PPR

Alzheimer hastalığının ve buna bağlı demansların biyobank ölçekli karakterizasyonu, çeşitli ansestrlerde hastalığa neden olan potansiyel varyantları, risk faktörlerini ve genetik değiştiricileri tanımlar.

Biobank-scale characterization of Alzheimer’s disease and related dementias identifies potential disease-causing variants, risk factors, and genetic modifiers across diverse ancestries

Makine çevirisi · Editoryal inceleme bekliyor

· 2024-11-04

DOI: 10.1101/2024.11.03.24313587

Open accessPreprintKaynağa git ↗

Araştırma özeti

Kaynak özetin Türkçe makine çevirisi. Klinik kullanım öncesinde özgün yayınla karşılaştırılmalı; hekim incelemesi değildir. cc0

Alzheimer hastalığı ve buna bağlı demanslar (AD/ADRD'ler) önemli bir küresel halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır ve bu durum, ancestriler arasında farklılık gösteren genetik ve çevresel faktörlerin karmaşık etkileşiminin altını çizmektedir. Küresel ölçekte adil, kişiselleştirilmiş terapötik müdahaleleri etkin bir şekilde uygulamak için, hastalığa neden olan mutasyonları ve genetik risk ve direnç faktörlerini çeşitli ata geçmişleri boyunca tanımlamak esastır. Dünya genelinde genetik-fenotipik korelasyonların araştırılması, araştırma bulgularının genellenebilirliğini arttırarak, hastalığın daha kapsayıcı ve evrensel bir anlayışına katkıda bulunur. Bu çalışma, AD / ADRD'lerin en büyük çoklu-adımlı tüm genom dizileme karakterizasyonunu gerçekleştirmek için biyobank ölçekli verilerden yararlandı. Bu koşulların etiyolojisini etkileyen potansiyel hastalığa neden olan, genetik risk ve dirençli varyantların değerli bir kataloğunu oluşturmayı amaçladık. 11 genetik ansestrde AD/ADRD'lerle ilişkili anahtar genlerden genetik varyantları iyice karakterize ettik, All of Us, UK Biobank, 100.000 Genom Projesi, Alzheimer Hastalığı Dizileme Projesi ve Parkinson Hastalığında Hızlandırılmış İlaçlar Ortaklığı'ndan elde edilen verileri kullandık, toplam 25.001 vaka ve 93.542 kontrol dahil. 18 bilinen patojenik ve 98 yeni varyant da dahil olmak üzere, muhtemelen hastalığa bağlı 116 varyantı önceliklendirdik. Daha önce kontroller arasında hastalığa neden olan varyantları tanımladık, bu da onların patojenliğini sorgulamamıza neden oldu. Özellikle, Afrika ve Afrika Admixed atalarının bireyleri arasında APOE epsilon4 / epsilon4 taşıyıcılarının daha yüksek bir sıklığını diğer ancestrilere kıyasla gösterdik, APOE ile ilişkili AD / ADRD'lerin ata kaynaklı modülasyonunu doğruladık. APOE'nin kapsamlı bir değerlendirmesi, TOMM40 rs11556505, APOE rs449647, 19q13.31 rs10423769, NOCT rs13116075, CASS4 rs6024870 ve APOE epsilon4 taşıyıcıları arasında farklı ancestrilerde LRRC37A rs2732703 varyantları tarafından verilen hastalık değiştirici bir etki ortaya çıkardı. Özetle, bilinen genlerdeki yerleşik ve yeni genetik varyantların en kapsamlı kataloğunu derleyerek, çeşitli ansestrlerde AD / ADRD'lere karşı direnç kazandırarak, genetik-fenotipik korelasyonlarına dair klinik bilgiler sağladık. Bu araştırmadan elde edilen bulgular, küresel ölçekte potansiyel klinik denemeler ve terapötik müdahaleler için önemli etkilere sahiptir. Son olarak, AD/ADRDs araştırma topluluğu için bu zayıflatıcı koşullarla ilgili temel, çevirisel ve klinik araştırmaları bilgilendirmeye ve desteklemeye yardımcı olacak erişilebilir ve kullanıcı dostu bir platform sunuyoruz ( https://niacard.shinyapps.io/MAMBARD_browser/).

Özgün kaynak özetini okuyun

Alzheimer’s disease and related dementias (AD/ADRDs) pose a significant global public health challenge, underscored by the intricate interplay of genetic and environmental factors that differ across ancestries. To effectively implement equitable, personalized therapeutic interventions on a global scale, it is essential to identify disease-causing mutations and genetic risk and resilience factors across diverse ancestral backgrounds. Exploring genetic-phenotypic correlations across the globe enhances the generalizability of research findings, contributing to a more inclusive and universal understanding of disease. This study leveraged biobank-scale data to conduct the largest multi-ancestry whole-genome sequencing characterization of AD/ADRDs. We aimed to build a valuable catalog of potential disease-causing, genetic risk and resilience variants impacting the etiology of these conditions. We thoroughly characterized genetic variants from key genes associated with AD/ADRDs across 11 genetic ancestries, utilizing data from All of Us, UK Biobank, 100,000 Genomes Project, Alzheimer’s Disease Sequencing Project, and the Accelerating Medicines Partnership in Parkinson’s Disease, including a total of 25,001 cases and 93,542 controls. We prioritized 116 variants possibly linked to disease, including 18 known pathogenic and 98 novel variants. We detected previously described disease-causing variants among controls, leading us to question their pathogenicity. Notably, we showed a higher frequency of APOE ε4/ε4 carriers among individuals of African and African Admixed ancestry compared to other ancestries, confirming ancestry-driven modulation of APOE -associated AD/ADRDs. A thorough assessment of APOE revealed a disease-modifying effect conferred by the TOMM40 rs11556505, APOE rs449647, 19q13.31 rs10423769, NOCT rs13116075, CASS4 rs6024870, and LRRC37A rs2732703 variants among APOE ε4 carriers across different ancestries. In summary, we compiled the most extensive catalog of established and novel genetic variants in known genes increasing risk or conferring resistance to AD/ADRDs across diverse ancestries, providing clinical insights into their genetic-phenotypic correlations. The findings from this investigation hold significant implications for potential clinical trials and therapeutic interventions on a global scale. Finally, we present an accessible and user-friendly platform for the AD/ADRDs research community to help inform and support basic, translational, and clinical research on these debilitating conditions ( https://niacard.shinyapps.io/MAMBARD_browser/ ).

Bilimsel değerlendirme

01

Araştırma sorusu

Sorunun kapsamı orijinal çalışma üzerinden değerlendirilir.

02

Yöntem ve örneklem

Çalışma tasarımı ve örneklem için kaynak makaleyi kontrol edin.

03

Temel bulgular

Bu kayıt için editoryal olarak onaylanmış bulgu özeti henüz yayımlanmadı.

04

Sınırlılıklar

Sonuçların genellenebilirliği, yanlılık ve klinik anlamı ayrıca incelenmelidir.

Bibliyografik veriden yöntem, örneklem veya klinik sonuç çıkarımı yapılmaz.